Kauzativní agens lymeské borreliózy, spirocheta Borrelia burgdorferi sensu lato (v širším slova smyslu) byla rozlišena pomocí analýzy genomu na několik geneticky determinovaných druhů. Článek ve stručnosti informuje o těchto druzích-genomospecies, zvláště pak o těch, které se na území České republiky vyskytují:

Borrela garinii, Borrelia afzelii, Borrelia lusitaniae. Borrelia burgdorferi sensu stricto (v užším slova smyslu) (do této skupiny se řadí typový kmen B31, izolovaný v USA) se prozatím nepodařila na území České republiky izolovat nebo detekovat, i když se v okolních státech vyskytuje.