Zprávy
CEM (SZÚ, Praha) 2001; 11(3):124-127.
Dominantní činnost NRL oboru epidemiologie a mikrobiologie v roce 2001
Část I: NRL v CEM
Desetiřádková sdělení
vypracovali vedoucí jednotlivých NRL, jako součást výročních zpráv
NRL pro streptokoky a enterokoky
1) Zjištění
mikrobiologických a epidemiologických dat potřebných pro formulaci programu
prevence časných novorozeneckých infekcí (EOD) vyvolaných S.agalactiae:
aktivní surveillance EOD, zjištění nosičství S.agalactiae ve vagině a
rektu u gravidních žen. 2) Vývoj metody
pro molekulární typizaci kmenů S.agalactiae. 3) Emm typizace kmenů S.pyogenes. 4) Monitorování výskytu
sérotypů S.pneumonie pro
zajištění efektivní aplikaci typově specifických pneumokokových vakcín. 5) Stanovení titru postvakcinačních typově
specifických pneumokokových protilátek v sérech vakcinovaných jedinců. 6)
Příprava náležitostí potřebných pro splnění akreditačního řízení.
NRL prošla
akreditačním řízením ČIA podle normy ČSN EN ISO/IEC 17025 a bylo jí vydáno osvědčení o akreditaci.
NRL
pro chřipku
-
program surveillance ARO v ČR i v rámci mezinárodní spolupráce
-
testování nově izolovaných kmenů chřipky vůči některým antivirotikum
-
zkvalitňování rychlé diagnostiky chřipky včetně testování nových
komerčních souprav
produkce dg antigenů a setů
-
NRL je aktivně zapojena do evropského systému surveillance chřipky (EISS
- jsme
rovnoprávným členem skupiny od roku 1997), dále NRL zapojena do programu
WHO
(FLU-NET atp.)
NRL
pro nechřipkové respirační viry
-
program surveillance ARO v CR i v rámci mezinárodní spolupráce
-
zkvalitňování rychlé diagnostiky nechřipkových respiračníchvirů,
testování nových komerčních diagnostických souprav
-
produkce diagnostických antigenů do EIA setů
-
NRL je zapojena do evropského systému surveillance chřipky (EISS), kde
je hlášen rovněž výskyt RSV
NRL
pro zarděnky, spalničky, parotitidu a parvovirus B 19
Hodnocení komerčních diagnostických souprav
formou expertizní činnosti.Vypracování návrhů postupů pro ověřování funkční
způsobilosti „in vitro“ diagnostických prostředků
pro diagnostiku zarděnek. Příprava vzorků pro EHK a vyhodnocování
výsledků.Účast v programu externího hodnocení kvality v lékařských
laboratořích INSTAND, NSR.Účast ve
studii ESEN 2-WP 1(MMR).Ověřování metody pro stanovení avidity IgG protilátek
proti viru zarděnek.Zavedení PCR pro průkaz
parvoviru B 19.Účast na připomínkovém řízení návrhu „Surveillance
spalniček v ČR ve fázi eliminace.Příprava podkladů pro dílčí úkol WHO
dokumentu „Zdraví pro všechny v 21.století“. Postgraduální výchova
v oblasti teratogenních virů. Příprava odborných materiálů a poskytování
konzultací pro vypracovávání diplomových
prací studentů 3.LF UK.
NRL pro chlamydie
Činnost laboratoře
byla zaměřena na vyšetřování pacientů se širokým spektrem klinických symptomů
respiračního a urogenitálního traktu, systémových chorob za použití testů
prokazujících antigen či DNA příslušného agens a sérologických testů (detekce
rodově specifických a druhově specifických protilátek). V květnu proběhlo 5.
kolo EHK-sérologie chlamydií, zúčastnilo se 47 laboratoří. V prosinci se konala
Chlamydiová konference s mezinár.účastí (250 účastníků), naše NRL byla jeden z
hlavních organizátorů. Podíleli jsme se na postgraduální výchově (3 akce).
Diplomantka 5.ročníku přírodovědecké fakulty UK v Praze se na našem pracovišti
podílela na zavedení metody PCR pro průkaz DNA Ch.pneumoniae.
NRL
pro toxoplasmózu
Vedle pravidelné
expertizní, školící, konzultační, diagnostické a konfirmační činnosti NRL
připravila a vyhodnotila dvě kola okružních vzorků pro 86 zúčastněných
laboratoří, zaměřená na diagnostiku oční toxoplasmózy a na testy u žen
plánujících otěhotnění.7. Konzultační den „Problémy toxoplasmózy“ navštívilo
více než 90 účastníků. Novými diagnostickými metodami, jejichž prověřování
v NRL začalo, jsou stanovení antitoxoplasmických IgE a kvantitativní
stanovení IgG pro potřeby oftalmologického vyšetření. V International
Journal for Parasitology vyšla publikace shrnující poznatky o epidemiologii
toxoplasmózy v ČR.
NRL pro enteroviry
Vyšetřování
případů akutních chabých paréz u
dětí do 15 let věku.U každého případu
jsou vyšetřeny 2 odběry stolic.V případě positivní identifikace polioviru
jsou izolát a původní vzorek stolice
zaslány do Regionální referenční laboratoře v Helsinkách pro určení, zda
se jedná o oslabený nebo divoký kmen polioviru.
Izolace a identifikace
enterovirů z pacientských materiálů (stolice, likvory a výtěry krku)
zasílaných do NRL.
Identifikace
pozitivních izolátů ze všech laboratoří ČR zasílaných do NRL
Sledování výskytu
enterovirů v odpadních vodách odebíraných z 8 míst ČR a ze 3
utečeneckých táborů
Vyšetřování protilátek
proti poliovirům a ostatním enetrovirům u pacientů.
Laboratoř spolupracuje
s Enterovirus Laboratory National Public Health Institute (KTL) Mannerheimintie 166 Helsinki
Finland.
NRL pro antibiotika
1. Surveillance
antibiotické rezistence (AR) invazivních izolátů bakterií v ČR
v rámci EARSS (European Antimicrobial Resistance Surveillance System)
2. Surveillance AR
komunitních původců močových a
respiračních infekcí
3. Surveillance AR
mimostřevních izolátů salmonel
4. Stopování MRSA
(methicilin/oxacilin rezistentních stafylokoků) v českých nemocnicích
5. Analýza
penicilinové a makrolidové rezistence pneumokoků a streptokoků
6. Příprava podkladů
pro správnou antibiotickou praxi
NRL Česká národní
sbírka typových kultur
Sbírka kultur
připravovala kmeny a hodnotící komentář (časopis Zprávy CEM) pro vnější
hodnocení kvality EHK-Bakteriologická diagnostika. Sbírka kultur prováděla
identifikaci neobvyklých patogenních mikroorganismů zasílaných
z mikrobiologických pracovišť v ČR a ve spolupráci s NRL pro ATB
identifikaci a uchování kmenů zasílaných do NRL ATB. CNCTC se podílela na
lyofilizaci kmenů a sér pro potřeby NRL v rámci SZÚ. CNCTC distribuovala
za finanční úhradu kmeny uvedené v katalogu Sbírky kultur.
NRL pro salmonely
1) Diagnostika a
sérotypizace terénních aberantních kmenů a kmenů vzácně se vyskytujících. Sběr
kmenů, jejich sérotypizace a biotypizace v rámci studie antibiotické
rezistence kmenů izolovaných v populaci ČR (2500 izolátů)
2) Spolupráce
s AS SZÚ při přípravě vzorků EHK.
3) Spolupráce na
řešení grantového úkolu IGA: Analýza salmonelóz vyvolaných Slamonella
Typhimurium ve vybraných lokalitách ČR pomocí subtypizačních metod (CHPŘ Brno)
4) Posuzování
diagnostických souprav a testů pro identifikaci salmonel.
5) Účast
v mezinárodním kontrolním systému EQAS (Dánsko, Holandsko)
NRL pro yersinie a
pasteurelly
1) Stanovení titru
yersiniových protilátek v séru suspektních pacientů
2) Biochemická a
serotypizační diagnostika kmenů yersinií
3) Přednášková a
konzultační činnost
NRL pro stafylokoky
Dominovala referenční
činnost. Bylo diagnostikováno 418 kmenů Staphylococcus aureus. Kmeny
byly podrobeny základní fenotypizaci. Byl zjištěn fagotyp (asi polovina kmenů
byla NT), dále produkce superantigenů (stafylokokové enterotoxiny A – E, TSST-1
a exfoliatiny) a slizu. V loňském roce
jsme potvrdili diagnózu Syndromu toxického šoku u třech případů a u několika
případů puchýřnatého onemocnění novorozenců (včetně dvou epidemií). I vloni
jsme přispěli k objasnění několika epidemií stafylokokové enterotoxikózy. Bylo
diagnostikováno 313 koaguláza-negativních stafylokoků, izolovaných ze závažného
klinického materiálu, z toho 2/3 z hemokultur. Podařilo se nám identifikovat
několik druhů, které dosud v ČR nebyly popsány. Výsledky byly prezentovány na
10 akcích v ČR i ve SR. Pokračovala
spolupráce s pracovišti PřF MU v
Brně.
NRL pro E.coli a shigely
1) Stanovení verocytotoxinu
u suspektních kmenů E.coli O157 a non O157
2) Vyhledávání a
vytvoření souboru kmenů pro studium kolicinotypie (sp. Kluyvera, sp. Leclercia)
3) Přednášková činnost
4) Spolupráce
s mikrobiologickou laboratoří Univerzity v Münsteru (dr. Bielaszewska)
Adresa zahraničního
pracoviště:
Institut für Hygiene,
Robert-Koch str. 41
D-48149 Münster,
Germany.
Zajištění provozu
Informačního systému bacilární tuberkulózy (ISBT) včetně vypracování Výroční
zprávy o mykobakteriologické diagnostice.
Předávání dat konzultantům oboru TRN
při KHS za účelem porovnání databází ISBT a RT (Registr tuberkulózy).
Spolupráce s Národní jednotkou dohledu nad tuberkulózou při FN Bulovka,
vzájemná výměna podkladů a údajů pro program EuroTB.
Zkušební provoz
automatického detekčního systému Bactec MGIT960 (Becton Dickinson)- izolace
mykobakterií , standardizované testy
lékové citlivosti.
Ověřování citlivosti na antituberkulotika u
kmenů Mycobacterium tuberculosis izolovaných v r. 2001
v ČR. Stanovení minimálních
inhibičních koncentrací na jiné
antibakteriální léky mikrodiluční metodou u rezistentních kmenů.
Účast v
mezinárodním externím hodnocení kvality
v rámci projektu CDC Atlanta a v rámci EHK supranacionálních
referenčních laboratoří WHO/IUATLD.
NRL-VH testovala a
vydala doporučení ke schválení 43
souprav pro stanovení markerů virových hepatitid. NRL-VH připravila a vyhodnotila celkem 6 sérií
kontrolních vzorků pro systém externího hodnocení kvality (EHK) pro markery
HBV, HAV a screeningové HIV, HBV, HCV. NRL-VH prováděla centrálně povinná
konfirmační vyšetření HCV a HBV pro transfúzní službu a vyžádaná konfirmační
vyšetření pro laboratoře vyšetřující markery virových hepatitid. NRL-VH zavedla do rutinní diagnostické praxe metody
na stanovení IgM anti-HEV, HDV RNA a HGV RNA. NRL-VH se úspěšně prošla
mezinárodními kontrolami kvality pro serologii virových hepatitid A-E (INSTAND, SRN) a NAT (EDQM, EU). NRL-VH se akreditovala u ČIA jako součást
tzv. Laboratoří CEM.
Bylo pokračováno v aktivní surveillance invazivního meningokokového onemocnění v České republice. Byl zjištěn mírný vzestup počtu onemocnění a zvýšená smrtnost oproti předchozímu roku. Detailní určení antigenních a genetických vlastností N. meningitidis (WCE, MLEE, PFGE, MLST) ukázalo, že převládá sérologická skupina B a většina kmenů nenáleží do hypervirulentní linie ET-15/37. Ve spolupráci s NRL pro ATB byla zjištěna přetrvávající dobrá citlivost meningokoků na antibiotika, což umožňuje pokračování současné profylaktické i terapeutické strategie. Byla rozšířena metoda PCR diagnostiky o detekci H. influenzae a S. pneumoniae a spolu s detekcí N. meningitidis je v NRL rutinně požívána. Ve spolupráci s MÚ AV ČR byla vypracována originální metoda sekvenační typizace (MLST) meningokoků z PCR produktů. NRL získala akreditaci ČIA.
Přímou PCR-
sekvenační metodou jsme zjistili prevalenci B.burgdorferi sensu stricto
v Praze, Příbrami, Hořovicích, ve východočeském kraji B.garinii-typ
IV,V a ojediněle III, na Moravě je infekce smíšená . B.afzelii-typ II se
vyskytuje sporadicky, především v západočeském kraji. Po epidemiologických
souvislostech se pátrá. U tažných ptáků
( vyšetřeno 86 ) a členovců
( vyšetřeno 2000)
převládá infekce B.garinii ( 46% infikovaných).
Coinfekci s r.Ehrlichia
jsme prokázali u pacientů (HGE a HME agens), dále u ptáků, koní, lovné zvěře (
E.phagocytophila) a u klíšťat. Sledovali jsme vývojový cyklus klíšťat a
podmínky přenosu agens v experimentálních chovech. Byly vypracovány 2
letáky: „ Chraňte se před klíšťaty“ a „Klíště není náš kamarád“ pro dospělou a
dětskou populaci. Pokračuje spolupráce s CDCP, členství v LD
fondation (USA), JSTD a Emerging Infectious Diseases.
1. Referenční
činnost - identifikace (konfirmace) nových případů HIV/AIDS v ČR, monitorování
progrese infekce u HIV infikovaných osob, zjišt'ování rezistence HIV kmenů na
antiretrovirové preparáty
2. Epidemiologická
surveillance HIV - monitorování výskytu a šíření HIV/IADS v ČR, aplikace metod
molekulární epidemiologie
3. Metodická
a kontrolní činnost - školení terénních pracovníků, příprava a hodnocení EHK
4. Expertizní
činnost - evaluace komerčních testů pro diagnostiku HIV/AIDS
5. Výzkumná
činnost - 2 projekty IGA MZ ČR, 1 projekt EU, výzkumný záměr v rámci, SZÚ
6. Osvětová
činnost - udržování www stránek s informacemi o výskytu HIV/AIDS v ČR, osvětové
programy pro různé populační skupiny
7. Pedagogická
činnost - pre i postgraduální
8. Mezinárodní
spolupráce - program EU "EuroHIV"
NRL pro analýzu epidemiologických dat
NRL nadále
spolupracovala s HS ČR na zajištění zákonného hlášení infekcí na území České
republiky. Epidat byl v roce 2001 registrován Úřadem pro ochranu osobních
údajů. Bylo v něm evidováno
dalších cca 140000 infekcí. Databáze
centra, ve které je více než 2 miliony
onemocnění, byla v průběhu roku upravena pro potřeby nového správního členění
republiky. Ve spolupráci s MZ ČR a oddělením biostatistiky SZÚ byla vytvořena
nová internetovská aplikace hlášení akutních respiračních onemocnění a ve
spolupráci se SW komisí Epidatu byla připravena nová verze Epidatu pro rok
2002. NRL průběžně poskytovala datovou podporu projektům SZÚ a HS. Analytická
práce se opírala o rozbory sezónní a věkové struktury trendů nemocnosti,
servisní práce o týdenní a měsíční přehledy nemocnosti distribuované formou
Zpráv CEM. Pracovníci NRL se v průběhu
roku zapojili konkrétními činnostmi do projektů WHO "Zdraví pro všechny v
21. století", NEHAP, BWC a do některých informačních systémů WHO a EU.
NRL pro dezinfekci a sterilizaci
NRL byla akreditovaná.
Účastnila se EHK - sterilizace.
V rámci placené
expertizní činnosti vypracovala
podklady pro schvalovací řízení MZ ČR k výrobě, distribuci, dovozu
dezinfekčních přípravků a uvedení sterilizátorů, obalových materiálů a
indikátorů sterilizace na tuzemský trh. Posuzovala napadení různých
objektů houbami a doporučovala postupy
dezinfekce, hodnotila odolnost materiálů k dezinfekčním přípravkům a odolnost
bakterií k dezinfekčním přípravkům.
Podílela se na
metodickém vedení hygienické služby a pracovníků provádějících dezinfekci a
sterilizaci v rámci pregraduální, postgraduální výchovy a rekvalifikací.
Spolupracuje při zavádění novinek z oboru do praxe se Společností pro
nemocniční hygienu, IPVZ Praha, IPVZ SZP Brno, Sdružení DDD, byl uspořádán
Konzultační den v DDD. Rozsáhlá je konzultační a publikační činnost.
NRL pro dezinsekci a deratizaci
NRL ověřovala,
formou placených expertiz, účinnost přípravků pro ochrannou dezinsekci a
deratizaci, které byly předloženy hlavnímu hygienikovi ČR k povolení. Ve
spolupráci se Sdružením DDD při ČSVTS se formou odborných přednášek podílela na
zajišťování kvalifikace ve smyslu zákona 258/2000 Sb. pro výkonné pracovníky,
kteří poskytují služby v ochranné dezinsekci a deratizaci podle
živnostenského zákona. Podílela se na vzdělávání pracovníků státní správy
v ochranné dezinsekci a deratizaci. Jako každoročně, NRL připravila a
publikovala seznam přípravků povolených hlavním hygienikem ČR pro ochrannou
dezinsekci a deratizaci k 1.1.2002. Z pověření hlavního hygienika ČR se
podílela na přípravě návrhu zákona
"o podmínkách uvádění biocidů na trh" a na přípravě návrhu změny
zákona
o ochraně
veřejného zdraví (změny v zákonu č.
274/2001 Sb.).
Elektron-mikroskopicky
byly v krvi a v mozkomíšním moku pacientů (› 1000 ) vyšetřených
metodou negativního barvení prokázány nejčastěji viry č.Herpesviridae a Picornaviridae.
V kostní dřeni a u transplantovaných pacientů byly zjištěny Parvoviridae
a Papovaviridae. V průjmových stolicích novorozenců byly rotaviry a
caliciviry. V likvorech u 45% pacientů s meningitidou a
encefalomeningitidou ( vyšetřeno 400 případů) byly zjištěny organismy (› 10 na
zorné pole při zv 10 000 x) velikosti
0.50 – 1.4 μm. Morfologicky, experimentálně a analyzou DNA
restrikčními enzymy byly organizmy
určeny jako mladé, nově rozdělené borrelie. Tyto 2-3μm dlouhé, 0.18
μm silné formy rostoucích borrelií mají poloviční počet diferencujících se
bičíků, proto jsou málo pohyblivé. Tenký vnější obal neobsahuje OspA antigen.
Vlivem nevhodných podmínek prostředí ( protilátky, lysozym) se stáčí do „
klubíčka“ a postupně je destruován vnitřní obsah nehráněný vnějším obalem .Tím
vzniká dvojitou membránou ohraničené granulum. Tyto formy nelze
diagnostikovat světelným mikroskopem.
Přímý průkaz koinfekce
r.Borrelia a r.Ehrlichia byl prokázán u pacientů, klíšťat a
zvířat, především u tažných ptáků (divoká kachna, husa, volavka, kos, vrána,
rackové). Morfologicky a sekvenací DNA byla ověřena HGE agens a E.phagocytophila.
NRL
pro leptospiry.
Dominantní činnost NRL spočívala v přípravě a
výrobě živých antigenů pro diagnostické účely vlastní a pto potřeby sérologické
diagnostiky leptospirózy v laboratořích hygienické služby a veterinární
služby v ČR. V NRL je udržován genofond národní sbírky leptospiorvých
kultur ČR. Vyrobená hyperimunní séra jsou užívána k externímu hodnocení
kvality (EHK) a úrovně rutinní diagnostiky v terénních laboratořích HS i
pro diagnostiku a konfirmaci klinického materiálu v NRL. V rámci
sledování přírodní ohniskovosti leptospirózy jsou ve spolupráci s KHS a
VFU Brno vyšetřováni drobní savci z oblastí epizootií. Kromě metodické
spolupráce s pracovišti HS provádí NRL přednáškovou, doškolovací
konziliární a publikační činnost v dané problematice a celorepublikový
monitoring nákazy. Byla navázána spolupráce s mikrobiology PřF MU
v Brně k využití chemotaxonomických metod k diagnostice
leptospirózy.
NRL pro herpetické viry
Vyšetřování vzorků od pacientů pro zdravotnická zařízení
– transplantovaní pacienti, HIV+, neurologičtí pacienti kojenci, speciální
vyšetřovací metody. Příprava vzorků a vyhodnocování EHK – serologie EBV, HSV,
VZV,identifikace virů . Atesty
komerčních diagnostických souprav.Výzkumná činnost: „Studium epidemiologie a
patogenezy lidského herpetického viru 8 v ČR“ (grant IGA), „Studium vztahů
herpetických virů k lidským onemocněním a možností jejich prevence“ (VZ
MZ) – vývoj metod kvantifikace virového genomu v klinickém materiálu a
jejich aplikace pro diagnostiku herpetických infekcí u imunodeficientních
pacientů, studium seroprevalence herpetických virů u chronicky nemocných,
diagnostický význam průkazu virové DNA v mozkomíšním moku u neurologických
pacientů. Pedagogická a školící činnost – odborné semináře, přednášky, články,
účast na konferencích, postgraduální kurzy pro IPVZ a odborné stáže, školení 3
aspirantů a jednoho studenta.
NRL
pro hemofilové nákazy
1) Monitorování
vlastností kmenů izolovaných v mikrobiologických laboratořích (ověřování
výsledků terénních laboratoří, biotypizace a serotypizace u Haemophilus
influenzae).
2)
Spolupráce při zajišění
surveillance programu invazivních onemocnení způsobených Haemophilus
influenzae b v České republice.
3)
Spolupráce při řešení projektu
NI / 6803-3 (IGA MZ ČR): „Studium vlastností kmenů Haemophilus influenzae
získaných v celostátním programu surveillance".
4) Typizace
kmenů Haemophilus influenzae izolovaných z ušního aspirátu od dětí do
dvou let věku pro vývoj nové hemofilové vakcíny - pilotní studie SmithKline
Beecham Biological.
5) Stanovení
hladiny protilátek vůči Haemophilus influenzae b metodou ELISA.
6) Metodická
činnost.
7) NRL
patří mezi laboratoře CEM, které byly akreditovány ČIA podle ČSN EN ISD/IEC
17025.
Sdělení zbývajících
laboratoří budou uveřejněna v následujícím čísle našeho časopisu.
Desetiřádková sdělení vypracovali
vedoucí jednotlivých NRL,
jako součást výročních zpráv.