Zprávy CEM (SZÚ,
Praha) 2004; 13(10-11):468-479.
Novinky v taxonomii
bakterií (č. 11)
Zdena Páčová, Vlastimil
Štětina
V taxonomickém okénku č. 11
předkládáme v tabulce I přehled
nových taxonů prokaryot (Bacteria,
Archaea), validně publikovaných v International Journal of Systematic
and Evolutionary Microbiology (IJSEM) č. 4, 5 a 6 v r. 2003 a uvedených na
validačních listech č. 92, 93 a 94 v témže časopise. Uvedeny jsou rovněž
nové kombinace, které vznikly přeřazením dříve validně publikovaného druhu do
nového rodu (původní jméno se stává synonymem). U nových kombinací neuvádíme
informace týkající se výskytu.
V textové části jsou uvedeny základní informace pouze
k nově popsaným klinicky významným taxonům z tabulky I. Údaje zde
uvedené mají informační charakter, se záměrem poukázat na novinky v taxonomii
bakterií, které se vážou k problematice humánní klinické bakteriologie.
Základní informace k nově popsaným klinicky významným bakteriálním
druhům
Achromobacter
insolitus, A. spanius
Gramnegativní tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující,
nefermentující, nehemolytické, kolonie bílé až světle hnědé, příbuzné druhu Alcaligenes faecalis.
Význačné
vlastnosti
kataláza, oxidáza pozitivní
ureáza, β-galaktosidáza,
β-glukuronidáza, α,β-glukosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza,
DNáza, arginin dihydroláza, lysin dekarboxyláza, ornithin dekarboxyláza negativní
netvoří kyselinu z glukózy, maltózy, fruktózy, xylózy a
adonitolu, indol
hydrolyzují
Tween 80
nehydrolyzují želatinu, eskulin, škrob
neredukují nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (krev, rána, moč)
Srovnávací
materiál
Achromobacter insolitus CCM 7182 (typová kultura)
Achromobacter
spanius CCM 7183 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
ACT DNT Glu Aco
Achromobacter insolitus + - - +
Achromobnacter spanius - - - -
Achromobacter denitrificans V + - +
Achromobacter piechaudii V - - +
Achromobacter xylosoxidans - + + +
Acinetobacter
parvus
Gramnegativní tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující,
nefermentující, nehemolytické, na rozdíl od ostatních acinetobakterů tvoří na agarových
mediích malé kolonie a roste na etanolu a acetátu jako jediném zdroji C.
Význačné
vlastnosti
kataláza pozitivní
netvoří kyselinu z glukózy
roste při 35 °C
neroste při 42 °C
nehydrolyzuje
želatinu
neutilizuje
citrát, akonitát, fenylacetát, malát,
malonát
Výskyt
humánní klinický materiál (ucho, oko, čelo, kůže), veterinární klinický
materiál (pes, ucho)
Srovnávací
materiál
Acinetobacter parvus CCM 7030 (typová kultura)
Rozlišující
testy
sekvencování genu pro 16S rRNA
AFLP
ARDRA
Actinomyces
nasicola
Grampozitivní,
krátké difteroidní tyčky, větvené i kokoidní formy se mohou vyskytovat,
fakultativně anaerobní, lépe rostou za anaerobních podmínek, nesporulující,
nepigmentující, konečný produkt metabolismu glukózy je kyselina octová, mléčná ,
jantarová (popis na základě jednoho kmene).
Význačné
vlastnosti
β-glukosidáza,
β-galaktosidáza, leucin arylamidáza, N-acetyl-β-glukominidáza pozitivní
kataláza, ureáza, lecitináza, lipáza, alkalická a
kyselá fosfatáza, α-galaktosidáza, β-glukuronidáza,
pyrrolidonyl arylamidáza negativní
tvoří kyselinu z fruktózy, celobiózy
netvoří kyselinu z glukózy, arabinózy, laktózy, manózy,
ribózy, sacharózy, trehalózy, xylózy, salicinu, manitolu
nehydrolyzuje
želatinu, škrob, eskulin
Výskyt
humánní klinický materiál (nos)
Základní rozlišující testy
LAC SUC AGA BGA
Actinomyces nasicola - - - +
Actinomyces hordeovulneris + + + +
Actinomyces marimammalium V - - -
Actinomyces
oricola
Grampozitivní tyčky až vlákna, někdy větvená,
fakultativně anaerobní až anaerobní, nesporulující, nehemolytické,
nepigmentující, konečný produkt metabolismu glukózy je kyselina octová, mléčná
, jantarová (popis na základě jednoho kmene).
Význačné
vlastnosti
α-galaktosidáza, α, β-glukosidáza,
pyrazinamidáza, leucin arylamidáza pozitivní
kataláza, ureáza, lipáza, lecitináza, arginin
dihydroláza, β-glukuronidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza negativní
tvoří kyselinu z celobiózy, fruktózy, sacharózy
netvoří kyselinu z laktózy, L-arabinózy, manitolu,
melibiózy, melezitózy, trehalózy, D-xylózy a sorbitolu, indol
hydrolyzuje
eskulin
nehydrolyzuje
želatinu, škrob
neredukuje nitráty
Výskyt
dentální absces
Základní rozlišující testy
MLZ TRE ARG APPA BGA
Actinomyces oricola - - - + -
Actinomyces denticolens V + - V +
Actinomyces naeslundii - V - - +
Actinomyces slackii - + - - +
Actinomyces urogenitalis + + + + +
Actinomyces viscosus - - - + +
Alistipes finegoldii
Grampozitivní tyčky, zakřivené, tvořící i dlouhá
vlákna, striktně anaerobní, nesporulující, slabě hemolytické, růstově náročné,
po 4-10 denní inkubaci kolonie na médiích s hemolyzovanou krví světle
hnědé až červenohnědé, hlavní metabolický produkt v PYG bujonu je kyselina
jantarová, fenotypově podobné skupině Bacteroides
fragilis a druhům rodu Porphyromonas.
Význačné
vlastnosti
alkalická a kyselá fosfatáza, α,β-galaktosidáza, α-glukosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza
pozitivní
kataláza, lecitináza, lipáza, leucin arylamidáza, β-glukosidáza, β-glukuronidáza
negativní
hydrolyzuje
želatinu
tvoří indol
redukuje nitráty
rezistentní
k vankomycinu, kanamycinu,
kolistinu
Výskyt
humánní klinický materiál (stolice, v 41% izolován
z apendicitidy u dětí)
Základní rozlišující testy
BIL20 PIG NGA AGA BGA
Alistipes finegoldii + + + + +
Alistipes putredinis - - - - -
Brevibacterium luteolum (popsáno jako B. lutescens)
Grampozitivní, difteroidní tyčky, aerobní,
nesporulující, nepohyblivé, netvoří cyklus tyčka-kok, žlutě pigmentující.
Význačné
vlastnosti
kataláza, pyrrolidonyl peptidáza, leucin arylamidáza pozitivní
ureáza, pyrazinamidáza negativní
netvoří kyselinu z cukrů
roste v 10% NaCl
hydrolyzuje
želatinu, kasein
nehydrolyzuje
eskulin, tyrozin, xantin
neredukuje nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (peritoneální tekutina, ucho), prostředí
Srovnávací
materiál
Brevibacterium luteolum CCM
7149 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
C20 NO3 Pha NGA PYR PYZ
Brevibacterium luteolum + - + + + +
Brevibacterium casei + V + - V +
Brevibacterium epidermidis + V - + - +
Brevibacterium iodinum + + + - - +
Brevibacterium linens + + +sl. - - +
Brevibacterium mcbrellneri - - + + - -
Brevibacterium otitidis - - - - + +
Brevibacterium paucivorans - - + V - -
Burkholderia cenocepacia
Gramnegativní tyčky, aerobní, nesporulující,
pohyblivé, většinou nehemolytické, některé kmeny žlutě pigmentující, dříve Burkholderia cepacia genomovar III.
Význačné
vlastnosti
kataláza, oxidáza (slabě) pozitivní
DNáza, arginin dihydroláza negativní
lysin dekarboxyláza pozitivní nebo negativní (podle
použité metody)
tvoří
kyselinu z glukózy
netvoří kyselinu z rhamnózy, rafinózy
hydrolyzuje
Tween 80
nehydrolyzuje
eskulin, škrob
Výskyt
pacienti s cystickou fibrózou (sputum), jiný klinický materiál,
rhizosféra zemědělských plodin
Srovnávací
materiál
Burkholderia cenocepacia CCM 4899 (typová kultura)
Rozlišující
testy
PCR
DNA-DNA hybridizace
Cetobacterium somerae
Gramnegativní tyčky, mikroaerotolerantní,
nesporulující, nepigmentující, hlavním produktem metabolizmu glukózy je kyselina octová.
Význačné
vlastnosti
α-,β-galaktosidáza, alkalická a kyselá fosfatáza pozitivní
kataláza, lecitináza, lipáza negativní
nehydrolyzuje
želatinu
redukuje nitráty
tvoří indol
citlivý ke kanamycinu, kolistin sulfátu, cefoxitinu,
klindamycinu, metronidazolu
rezistentní
k ampicilinu, penicilinu G, trimetoprim/sulfametoxazolu, vankomycinu,
20% žluči
Výskyt
humánní klinický materiál (stolice)
Rozlišující
testy
sekvencování genu pro 16S rRNA
DNA-DNA hybridizace
analýza mastných kyselin
enzymatické aktivity (API ZYM, AN
MicroPlate)
Clostridium bolteae
Grampozitivní tyčky, striktně anaerobní, sporulující,
nepigmentující, sacharolytické, hlavními produkty metabolismu glukózy jsou
kyselina octová a mléčná, nový druh ve fylogenetické skupině „Clostridium coccoides“, nejblíže
příbuzný druhu Clostridium
clostridiiforme.
Význačné
vlastnosti
kyselá fosfatáza, α-,β-galaktosidáza, α-glukosidáza pozitivní
kataláza, ureáza, lecitináza, lipáza negativní
tvoří kyselinu z většiny cukrů
netvoří kyselinu z manitolu, inulinu, laktózy, melibiózy, ribózy a salicinu, indol
nehydrolyzuje eskulin, želatinu
neredukuje nitráty
citlivý ke kanamycinu, kolistin sulfátu
rezistentní k ampicilinu a obvykle k piperacilinu,
tikarcilinu, vankomycinu
Výskyt
humánní klinický materiál
(stolice, krev, intraabdominální absces)
Rozlišovací metody
sekvencování genu pro 16S
rRNA
DNA-DNA hybridizace
analýza mastných kyselin
enzymatické aktivity (API
ZYM, Rapid ID ANAII)
Corynebacterium
atypicum
Grampozitivní, difteroidní tyčky,
fakultativně anaerobní, nesporulující, nepohyblivé, nehemolytické, alipofilní,
neobsahuje mykolové kyseliny (popis na
základě jednoho kmene).
Význačné vlastnosti
kataláza, β-glukuronidáza, leucin arylamidáza pozitivní
ureáza, alkalická a kyselá fosfatáza, α-,β-glukosidáza, α-,β-galaktosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza, pyrrolidonyl arylamidáza,
pyrazinamidáza negativní
tvoří kyselinu z glukózy, maltózy, ribózy, sacharózy
netvoří kyselinu z laktózy, D-xylózy, manitolu
roste v 7,5% NaCl
neroste v 10% NaCl
neredukuje nitráty
netvoří acetoin
Výskyt
humánní klinický materiál
Základní rozlišující testy
GLU aPHS BGR PYZ ESL
Corynebacterium atypicum + + - - -
Corynebacterium amycolatum + - + + -
Corynebacterium glucuronolyticum + + + - V
Corynebacterium kroppenstedtii + - + V +
Corynebacterium mastitidis - - + + -
Dialister invisus
Gramnegativní
kokobacily, striktně anaerobní, nesporulující, nepohyblivé, asacharolytické,
pomalu rostoucí, v tekutých médiích pouze slabý zákal, stimulace růstu s
1% karbohydrátů.
Význačné vlastnosti
kataláza, ureáza, arginin dihydroláza negativní
neroste ve 20% žluči
nehydrolyzuje eskulin
netvoří indol
Výskyt
dutina ústní (infekce zubní dřeně a ozubice)
Rozlišovací
testy
sekvencování genu pro 16S rRNA
SDS-PAGE
detekce enzymů (Rapid ID 32A)
Kerstersia gyiorum
Gramnegativní
tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující, nefermentující, nehemolytické, kolonie
bílé až světle hnědé, příbuzné rodům Alcaligenes,
Achromobacter, Bordetella a Pigmentiphaga.
Význačné vlastnosti
kataláza pozitivní
oxidáza, ureáza, arginin dihydroláza, lysin
dekarboxyláza, ornithin dekarboxyláza, DNáza, β-galaktosidáza
negativní
roste při 42 °C
nehydrolyzuje
želatinu, eskulin, škrob
neredukuje nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (stolice, vřed, sputum)
Srovnávací
materiál
Kerstersia gyiorum CCM 7184 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
OXI C42 Glu Cpr Adi ESL
Kerstersia gyiorum - + - + - -
Alcaligenes faecalis + + - + - -
Achromobacter denitrificans + + - + + +
Achromobacter piechaudii + + - - + -
Achromobacter xylosoxidans + + + + + +
Bordetella bronchiseptica + + - V + -
Bordetella hinzii + + - + + +
Bordetella holmesii + - - - - -
Bordetella pertussis + - - - - -
Bordetella petrii + NT - + + -
Bordetella trematum - + - - + +
Luteococcus sanguinis
Grampozitivní koky, fakultativně anaerobní (popis na
základě jednoho kmene).
Význačné
vlastnosti
kataláza, alkalická fosfatáza, α-,β-galaktosidáza, α-,β-glukosidáza, leucin arylamidáza, pyrrolidonyl
arylamidáda, pyrazinamidáza pozitivní
ureáza, β-glukuronidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza negativní
tvoří kyselinu z glukózy, maltózy, laktózy, sacharózy,
manitolu
netvoří kyselinu z D-xylózy, ribózy
hydrolyzuje
želatinu, eskulin
netvoří acetoin
neredukuje nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (krev)
Základní rozlišující testy
LAC BGR PYR NO3
Luteococcus sanguinis + - + +
Luteococcus japonicus - - + -
Luteococcus peritonei + + - +
Microbacterium paraoxydans
Grampozitivní koryneformní tyčky, nesporulující,
pohyblivé, aerobní, kolonie tvoří žlutý pigment, nejblíže příbuzné druhu Microbacterium oxydans.
Význačné
vlastnosti
kataláza, DNáza, α-glukosidáza, leucin arylamidáza pozitivní
oxidáza, β-glukosidáza, β-glukuronidáza negativní
tvoří kyselinu z glukózy, sacharózy, maltózy,
galaktózy, fruktózy, manózy, manitolu
netvoří kyselinu ze salicinu
hydrolyzuje
želatinu, kasein, eskulin (opožděně)
nehydrolyzuje
tyrozin
Výskyt
humánní klinický materiál (krev, bronchiální aspirát), rostlinný
materiál
Základní rozlišující testy
C40 SAL BGL Lac
Microbacterium paraoxydans + - - +
Microbacterium oxydans - + + -
Nocardia puris
Grampozitivní hyfy s nepravidelným větvením,
vrůstající do agaru a rozpadající se na tyčky, rozmezí růstu (22 – 45 °C),
nejblíže příbuzné druhům Nocardia abscessus, N. cyriacigeorgica a N. farcinica (popis na základě jednoho
kmene).
Význačné
vlastnosti
arginin dihydroláza, ornithin dekarboxyláza negativní
utilizuje acetát, citrát, glukózu, maltózu, sacharózu, manitol,
sorbitol
neutilizuje
laktát, acetamid, adonitol,
celobiózu, galaktózu, laktózu, melezitózu, rhamnózu, trehalózu, xylózu
hydrolyzuje
eskulin
nehydrolyzuje želatinu, kasein, tyrozin, xantin
Výskyt
humánní absces
Základní rozlišující testy
ESL Cit Gal Mlt Tre Man
Nocardia puris + + - + - +
Nocardia abscessus - + - + + -
Nocardia asteroides + - - - - -
Nocardia brasiliensis + + + + + +sl.
Nocardia cyriacigeorgica + - - - - -
Nocardia farcinica + - - + + -
Nocardia otitidisaviarum + - - - +sl. +
Nocardia paucivorans - - - - + -
Nocardia transvalensis - + + + + +
Nocardia vaccinii - + + - + -
Nocardia veterana + - - - - -
Paracoccus yeei (popsán jako P.
yeeii)
Gramnegativní diplokoky, kokotyčky, často
s vakuolami, aerobní, nesporulující, nepohyblivé, nehemolytické, kolonie
mukózní až extrémně mukózní, první druh rodu Paracoccus, izolovaný z klinického materiálu (dříve CDC
skupina EO-2), fenotypově podobný druhům Psychrobacter
immobilis, Paracoccus denitrificans, P. versutus, P. aminophilis a P. solventivorans.
Význačné
vlastnosti
kataláza, oxidáza, ureáza pozitivní
lysin dekarboxyláza negativní
tvoří kyselinu z glukózy, laktózy, xylózy
netvoří kyselinu ze sacharózy, indol
roste na MacConkeyově agaru
nehydrolyzuje želatinu, eskulin
redukuje nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (vřed, rána, krev, kůže, oko, ucho,
cerebrospinální tekutina)
Srovnávací
materál
Paracoccus yeei CCM
7173 (typová kultura)
Rozlišovací
metody
sekvencování genu pro 16S rRNA
analýza mastných kyselin
Ralstonia insidiosa
Gramnegativní tyčky, aerobní, nesporulující,
nefermentující, pohyblivé, rostou na BCSA, dříve Ralsonia pickettii – like.
Význačné
vlastnosti
kataláza, oxidáza, lipáza, fosfatáza, pyrrolidonyl aminopeptidáza pozitivní
lysin dekarboxyláza, arginin dihydroláza, α-,β-glukosidáza negativní
netvoří kyselinu z glukózy, laktózy a sacharózy, indol
nehydrolyzuje
želatinu
redukuje nitráty
Výskyt
humánní klinický materiál (sputum), prostředí (aktivovaný kal, půda,
voda)
Srovnávací
materiál
Ralstonia insidiosa CCM 7174 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
NO3 URE Ara Man Cit NGA
Ralstonia insidiosa + V - - + -
Ralstonia eutropha + - - - + +
Ralstonia gilardii - - - - - -
Ralstonia mannitolilytica - + + + + +
Ralstonia paucula - + - - + -
Ralstonia picketii + V + - + +
Ralstonia solanacearum + - - - + -
Roseomonas gilardii subsp. rosea,
R. mucosa
Gramnegativní kokotyčky, aerobní, nefermentující,
kolonie jsou mukózní (silně mukózní u druhu R.
mucosa), růžové, neabsorbují dlouhovlnné UV záření, nevyžadují metanol,
oxidáza variabilní, biochemickými reakcemi téměř neodlišitelné od druhů R. gilardii subsp. gilardii a R. cervicalis,
oba druhy bývají nejčastěji izolovanými druhy rodu Roseomonas.
Význačné
vlastnosti
kataláza pozitivní
β-galaktosidáza, arginin dihydroláza negativní
netvoří kyselinu z glukózy, indol
neutilizují manózu, manitol,
N-acetylglukosamin, maltózu, kaprát, fenylacetát
utilizují malát, citrát
neredukují nitráty
citlivé na amikacin, ciprofloxacin, často na imipenem,
tikarcilin/klav. kyselinu, R. gilardii subsp.
rosea na ampicilin
rezistentní na cefepim, ceftazidim, často na
trimetoprim/sulfametoxazol, R. mucosa na
ampicilin
Výskyt
humánní klinický materiál (krev)
Srovnávací
materiál
Roseomonas gilardii subsp. rosea CCM
7178 (typová kultura)
Roseomonas
mucosa CCM 7177 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
ESL NO3 GLY GAL
Roseomonas gilardii subsp. rosea - - NT NT
Roseomonas mucosa - - NT NT
Roseomonas cervicalis - - - -
Roseomonas fauriae + + + +
Roseomonas gilardii subsp. gilardii - - + V
Streptococcus oligofermentans
Grampozitivní koky v krátkých
řetízcích, nesporulující, nepohyblivé, fakultativně anaerobní, a-hemolytické, kolonie na
BHI agaru tmavě žluté, patří do „mitis“ skupiny streptokoků, nejblíže příbuzný
druh Streptococcus sinensis.
Význačné vlastnosti
kataláza, β-galaktosidáza, arginin dihydroláza negativní
tvoří kyselinu z glukózy, sacharózy, manózy, maltózy
netvoří kyselinu z arabinózy, melibiózy, celobiózy, amygdalinu,
ribózy, manitolu, salicinu a sorbitolu, acetoin
hydrolyzuje
hippurát
nehydrolyzuje
eskulin
Výskyt
humánní klinický materiál (sliny, dentální plak)
Základní rozlišující testy (od některých příbuzných
druhů „mitis“ skupiny)
ARG HIP TRE MLB BGA aPHS
Streptococcus oligofermentans - + V - - V
Streptococcus infantis - - - - + -
Sterptococcus mitis - - - V V V
Streptococcus oralis - - V V V V
Streptococcus pneumonie V - + - - -
Streptococcus sanguinis + - + V + V
Streptococcus sinensis + - + - - -
Wautersia respiraculi (popsána jako Ralstonia
respiraculi)
Gramnegativní tyčky, nesporulující, aerobní,
nefermentující, nerostou na BCSA.
Význačné
vlastnosti
kataláza, oxidáza, pyrrolidonyl aminopeptidáza pozitivní
ureáza , lipáza, β-galaktosidáza,
lysin dekarboxyláza negativní
netvoří kyselinu z glukózy, indol
utilizuje kaprát, glukonát
neutilizuje
glukózu, arabinózu, manózu, manitol,
N-acetylglukosamin, maltózu, citrát, fenylacetát
nehydrolyzuje
želatinu
Výskyt
respirační trakt pacientů s cystickou fibrózou
Srovnávací
materiál
Wautersia respiraculi CCM 7175 (typová kultura)
Základní rozlišující testy
NO3 URE NGA Cit Pha
Wautersia respiraculi V - - - -
Ralstonia eutropha + - + + +
Ralstonia gilardii - - - - V
Ralstonia insidiosa + V - + +
Ralstonia mannitolilytica - + + + -
Ralstonia paucula - + - + +
Ralstonia pickettii + + + + +
Vysvětlivky:
Aco = utilizace akonitátu; ACT = růst na acetamidu; Adi
= utilizace adipátu; AGA = α-galaktosidáza; aPHS=alkalická
fosfatáza; APPA = alanin fenylalanin
prolin arylamidáza; Ara = utilizace
arabinózy; ARG = arginin
dihydroláza; BGA = β-galaktosidáza; BGL
= β-glukosidáza; BGR
= β-glukuronidáza; BIL20 = růst ve 20% žluči; Cit = utilizace citrátu; Cpr = utilizace kaprátu; C20 = růst při 20 °C; C40 = růst při 40 °C; C42 = růst při 42 °C; DNT = denitrifikace; ESL = hydrolýza eskulinu; GAL = kyselina z galaktózy; Gal = utilizace galaktózy; GLU = kyselina z glukózy; Glu = utilizace glukózy; GLY = kyselina z glycerolu; HIP = hydrolýza hippurátu; LAC = kyselina z laktózy; Lac = utilizace laktózy; LAR = leucin arylamidáza; Man = utilizace manitolu; MLB = kyselina z melibiózy; Mlt = utilizace maltózy; MLZ = kyselina z melezitózy; NGA = N-acetyl-β-glukosaminidáza; NO3
= redukce nitrátů; OXI = oxidáza; Pha = utilizace fenylacetátu; PIG = tvorba pigmentu; PYR = pyrrolidonyl arylamidáza; PYZ = pyrazinamidáza; SAL = kyselina ze salicinu; SUC = kyselina ze sacharózy; Suc =
utilizace sacharózy; TRE = kyselina
z trehalózy; Tre = utilizace
trehalózy; URE = ureáza; + =
90-100% pozitivních reakcí; +sl. =
slabě pozitivní reakce; V = 20-80%
pozitivních reakcí; - = 0-10%
pozitivních reakcí; NT =
netestováno; CCM = Česká sbírka
mikroorganismů, Brno
Zdena Páčová
Vlastimil Štětina
Česká sbírka mikroorganismů
Přírodovědecká fakulta
Masarykovy univerzity, Brno
Tabulka
I: NOVÉ DRUHY PROKARYOT VČETNĚ NOMENKLATORICKÝCH ZMĚN (červenec 2003 -
prosinec 2003) |
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|||
Druh |
Původní
označení |
Riziková |
|
Výskyt |
Autor |
Citace v
IJSEM |
|
|
skupina |
|
|
||||||
Acinetobacter
baylyi |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:960 |
|||
Acinetobacter
bouvetii |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:961 |
|||
Acinetobacter
gerneri |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:961 |
|||
Acinetobacter
grimontii |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:961 |
|||
Acinetobacter
parvus |
|
? |
humánní
klinický materiál, pes |
Nemec et
al. 2003 |
53:1566 |
|||
Acinetobacter
tandoii |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:962 |
|||
Acinetobacter
tjernbergiae |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:961 |
|||
Acinetobacter
towneri |
|
? |
aktivovaný
kal |
Carr et
al. 2003 |
53:961 |
|||
Actinomyces
nasicola |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Hall et
al. 2003 |
53:1448 |
|||
Actinomyces
oricola |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Hall et
al. 2003 |
53:1518 |
|||
Aeromicrobium
marinum |
|
? |
mořská
voda |
Bruns et
al. 2003 |
53:1922 |
|||
Agreia
pratensis |
<- Subtercola
pratensis |
? |
|
(Behrendt
et al. 2002) Schumann et al. 2003 |
53:2043 |
|||
Agromyces
albus |
|
? |
rostlinný
materiál |
Dorofeeva
et al. 2003 |
53:1438 |
|||
Achromobacter
denitrificans |
<- Alcaligenes
denitrificans |
2 |
|
(Rüger
and Tan 1983) Coenye et al. 2003 |
53:1829 |
|||
Achromobacter
insolitus |
|
? |
humánní
klinický materiál, prostředí |
Coenye et
al. 2003 |
53:1823 |
|||
Achromobacter
spanius |
|
? |
humánní
klinický materiál, prostředí |
Coenye et
al. 2003 |
53:1823 |
|||
Algoriphagus
ratkowskyi |
|
? |
mořský
led, slané jezero (Antarktida) |
Bowman et
al. 2003 |
53:1352 |
|||
Alicyclobacillus
pomorum |
|
? |
zkažený
ovocný džus |
Goto et
al. 2003 |
53:1542 |
|||
Alicyclobacillus
sendaiensis |
|
? |
půda |
Tsuruoka
et al. 2003 |
53:1084 |
|||
Alistipes
finegoldii |
|
? |
humánní
materiál |
Rautio et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Alistipes
putredinis |
<- Bacteroides
putredinis |
2 |
|
(Weinberg
et al. 1937) Rautio et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Alkaliphilus
crotonatoxidans |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Cao et
al. 2003 |
53:973 |
|||
Alkanindiges
illinoisensis |
|
? |
kontaminovaná
půda, ropné pole |
Bogan et
al. 2003 |
53:1394 |
|||
Alteromonas
marina |
|
? |
mořská
voda |
Yoon et
al. 2003 |
53:1629 |
|||
Amycolatopsis
balhimycina |
|
? |
půda |
Wink et
al. 2003 |
53:935 |
|||
Amycolatopsis
kentuckyensis |
|
? |
kůň |
Labeda et
al. 2003 |
53:1603 |
|||
Amycolatopsis
keratiniphila subsp.
nogabecina |
? |
půda |
Wink et
al. 2003 |
53:935 |
||||
Amycolatopsis
lexingtonensis |
|
? |
kůň |
Labeda et
al. 2003 |
53:1603 |
|||
Amycolatopsis
pretoriensis |
|
? |
kůň |
Labeda et
al. 2003 |
53:1605 |
|||
Amycolatopsis
tolypomycina |
|
? |
půda |
Wink et
al. 2003 |
53:935 |
|||
Amycolatopsis
vancoresmycina |
|
? |
půda |
Wink et
al. 2003 |
53:935 |
|||
Anaerolinea
thermophila |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Sekiguchi
et al. 2003 |
53:1850 |
|||
Anoxybacillus
gonensis |
|
? |
horké
prameny |
Belduz et
al. 2003 |
53:1319 |
|||
Anoxynatronum
sibiricum |
|
? |
sodné
jezero |
Garnova
et al. 2003 |
53:1219 |
|||
Arenibacter
troitsensis |
|
? |
mořský
sediment |
Nedashkovskaya
et al. 2003 |
53:1289 |
|||
Arthrobacter
gandavensis |
|
? |
hovězí
dobytek |
Storms et
al. 2003 |
53:1883 |
|||
Arthrobacter
koreensis |
|
? |
půda |
Lee et
al. 2003 |
53:1280 |
|||
Aurantimonas
coralicida |
|
? |
mořský
korál |
Denner et
al. 2003 |
53:1120 |
|||
Bacillus
aeolius |
|
? |
mořské
prostředí |
Gugliandolo
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Bacillus
aquimaris |
|
? |
mořská
voda v pásmu přílivu |
Yoon et
al. 2003 |
53:1302 |
|||
Bacillus
krulwichiae |
|
? |
půda
kontaminovaná aromatickými sloučeninami |
Yumoto et
al. 2003 |
53:1536 |
|||
Bacillus
marisflavi |
|
? |
mořská
voda v pásmu přílivu |
Yoon et
al. 2003 |
53:1302 |
|||
Balnearium
lithotrophicum |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Takai et
al. 2003 |
53:1953 |
|||
Bifidobacterium
thermacidophilum subsp.
porcinum |
? |
faeces
selete |
Zhu et
al. 2003 |
53:1622 |
||||
Bosea
minatitlanensis |
|
? |
kal z
bioreaktoru |
Ouattara
et al. 2003 |
53:1250 |
|||
Brachybacterium
muris |
|
? |
laboratorní
myš, játra |
Buczolits
et al. 2003 |
53:1959 |
|||
Brevibacterium
luteolum |
<- Brevibacterium
lutescens |
? |
humánní
klinický materiál, prostředí |
Wauters
et al. 2003 corrig. list editor 2004 |
53:1324 |
|||
Brumimicrobium
glaciale |
|
? |
mořský
led, sediment (Antarktida) |
Bowman et
al. 2003 |
53:1352 |
|||
Burkholderia
cenocepacia |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Vandamme
et al. 2003 |
53:935 |
|||
Burkholderia
sordidicola |
|
? |
houby,
infekce |
Lim et
al. 2003 |
53:1635 |
|||
Caenibacterium
thermophilum |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Manaia et
al. 2003 |
53:1380 |
|||
Caldilinea
aerophila |
|
? |
horké
sirnaté prameny |
Sekiguchi
et al. 2003 |
53:1850 |
|||
Caldisphaera
lagunensis |
|
? |
kyselý
horký pramen |
Itoh et
al. 2003 |
53:1153 |
|||
Cetobacterium
somerae |
|
? |
humánní
materiál (stolice) |
Finegold
et al. 2003 |
53:1219 |
|||
Clostridium
amygdalinum |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Parshina
et al. 2003 |
53:1797 |
|||
Clostridium
bolteae |
|
? |
humánní
materiál |
Song et
al. 2003 |
53:935 |
|||
Clostridium
bowmanii |
|
? |
jezero
(Antarktida) |
Spring et
al. 2003 |
53:1027 |
|||
Clostridium
caminithermale |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Brisbarre
et al. 2003 |
53:1047 |
|||
Clostridium
estertheticum subsp.
laramiense |
<- Clostridium
laramiense |
1 |
|
(Kalchayanand
et al. 1993) Spring et al. 2003 |
53:1028 |
|||
Clostridium
frigoris |
|
? |
jezero
(Antarktida) |
Spring et
al. 2003 |
53:1027 |
|||
Clostridium
lacusfryxellense |
|
? |
jezero
(Antarktida) |
Spring et
al. 2003 |
53:1027 |
|||
Clostridium
psychrophilum |
|
? |
jezero
(Antarktida) |
Spring et
al. 2003 |
53:1028 |
|||
Corynebacterium
aquilae |
|
? |
orel |
Fernández-Garayzábal
et al. 2003 |
53:1138 |
|||
Corynebacterium
atypicum |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Hall et
al. 2003 |
53:1067 |
|||
Corynebacterium
sphenisci |
|
? |
tučňáci |
Goyache
et al. 2003 |
53:1012 |
|||
Corynebacterium
suicordis |
|
? |
prase,
respirační onemocnění |
Vela et
al. 2003 |
53:2030 |
|||
Croceibacter
atlanticus |
|
? |
mořská
voda |
Cho and
Giovannoni 2003 |
53:935 |
|||
Crocinitomix
catalasitica |
|
? |
ježovka;
litorál, zmrzlý písek (Aljaška) |
Bowman et
al. 2003 |
53:1353 |
|||
Cryomorpha
ignava |
|
? |
mořská
voda, křemen |
Bowman et
al. 2003 |
53:1353 |
|||
Deferribacter
abyssi |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Miroshnichenko
et al. 2003 |
53:1640 |
|||
Delftia
tsuruhatensis |
|
? |
zpracování
odpadní vody |
Shigematsu
et al. 2003 |
53:1482 |
|||
Desulfomicrobium
macestii |
<- Desulfobacterium
macestii |
1 |
|
(Gogotova
and Vainstein 1989) Hippe et al. 2003 |
53:1129 |
|||
Desulfonatronum
thiodismutans |
|
? |
sodné
jezero |
Pikuta et
al. 2003 |
53:1331 |
|||
Desulfonauticus
submarinus |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Audiffrin
et al. 2003 |
53:1589 |
|||
Desulfosporosinus
auripigmenti |
<- Desulfotomaculum
auripigmentum |
1 |
|
(Newman
et al. 1997) Stackebrandt et al. 2003 |
53:1442 |
|||
Desulfotomaculum
solfataricum |
|
? |
kal,
solfatarové pole (Island) |
Goorissen
et al. 2003 |
53:1228 |
|||
Devosia
neptuniae |
|
? |
luštěnina
(Indie) |
Rivas et
al. 2003 |
53:935 |
|||
Dialister
invisus |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Downes et
al. 2003 |
53:1940 |
|||
Diaphorobacter
nitroreducens |
|
? |
aktivovaný
kal |
Khan and
Hiraishi 2002 |
53:936 |
|||
Enhygromyxa
salina |
|
? |
mořské
pobřeží |
Iizuka et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Ensifer
arboris |
<- Sinorhizobium
arboris |
1 |
|
(Nick et
al. 1999) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
fredii |
<- Sinorhizobium
fredii |
1 |
|
(Scholla
and Elkan 1984) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
kostiensis |
<- Sinorhizobium
kostiense |
1 |
|
(Nick et
al. 1999) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
kummerowiae |
<- Sinorhizobium
kummerowiae |
? |
|
(Wei et
al. 2002) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
medicae |
<- Sinorhizobium
medicae |
1 |
|
(Rome et
al. 1996) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
meliloti |
<- Sinorhizobium
meliloti |
1 |
|
(Dangeard
1926) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
saheli |
<- Sinorhizobium
saheli |
1 |
|
(De
Lajudie et al. 1994) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
terangae |
<- Sinorhizobium
terangae |
1 |
|
(De
Lajudie et al. 1994) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Ensifer
xinjiangensis |
<- Sinorhizobium
xinjiangense |
1 |
|
(Chen et
al. 1988) Young 2003 |
53:2109 |
|||
Enterococcus
canis |
|
? |
pes |
De Graef
et al. 2003 |
53:1073 |
|||
Erythrobacter
flavus |
|
? |
mořská
voda |
Yoon et
al. 2003 |
53:1173 |
|||
Eubacterium
pyruvativorans |
|
? |
ovce
(bachor) |
Wallace
et al. 2003 |
53:969 |
|||
Flavobacterium
gelidilacus |
|
? |
jezero
(Antarktida) |
Van
Trappen et al. 2003 |
53:1244 |
|||
Fulvimarina
pelagi |
|
? |
mořská
voda |
Cho and
Giovannoni 2003 |
53:1858 |
|||
Garciella
nitratireducens |
|
? |
ropný vrt |
Miranda-Tello
et al. 2003 |
53:1513 |
|||
Gemmatimonas
aurantiaca |
|
? |
bioreaktor
na zpracování odpadních vod |
Zhang et
al. 2003 |
53:1161 |
|||
Gordonia
paraffinivorans |
|
? |
ropný vrt |
Xue et
al. 2003 |
53:1645 |
|||
Gordonia
sihwensis |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Kim et
al. 2003 |
53:1432 |
|||
Gordonia
sinesedis |
|
? |
půda |
Maldonado
et al. 2003 |
53:1219 |
|||
Grimontia
hollisae |
<- Vibrio
hollisae |
2 |
|
(Hickman
et al. 1982) Thompson et al. 2003 |
53:1617 |
|||
Halobacillus
karajensis |
|
? |
slaná
půda |
Amoozegar
et al. 2003 |
53:1062 |
|||
Halosimplex
carlsbadense |
|
? |
krystaly
soli 250 mil. let |
Vreeland
et al. 2003 |
53:936 |
|||
Herbaspirillum
lusitanum |
|
? |
kořenové
hlízy, luštěniny |
Valverde
et al. 2003 |
53:1982 |
|||
Histophilus
somni |
|
? |
hovězí
dobytek, ovce |
Angen et
al. 2003 |
53:1455 |
|||
Chlorobaculum
tepidum |
<- Chlorobium
tepidum |
1 |
|
(Wahlund
et al. 1996) Imhoff 2003 |
53:950 |
|||
Idiomarina
loihiensis |
|
? |
podmořská
sopka |
Donachie
et al. 2003 |
53:1878 |
|||
Kerstersia
gyiorum |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Coenye et
al. 2003 |
53:1830 |
|||
Kitasatospora
kifunensis |
<- Streptomyces
kifunensis |
1 |
|
(Nakagaito
et al. 1993) Groth et al. 2003 |
53:2038 |
|||
Kitasatospora
putterlickiae |
|
? |
rostliny,
rhizosféra |
Groth et
al. 2003 |
53:2037 |
|||
Kribbella
koreensis |
<- Hongia
koreensis |
1 |
|
(Lee et
al. 2000) Sohn et al. 2003 |
53:1007 |
|||
Lactobacillus
kitasatonis |
|
? |
kuře
(střevo) |
Mukai et
al. 2003 |
53:2058 |
|||
Leifsonia
aurea |
|
? |
porost
cyanobakterií, vodní nádrž (Antarktida) |
Reddy et
al. 2003 |
53:983 |
|||
Leifsonia
rubra |
|
? |
porost
cyanobakterií, vodní nádrž (Antarktida) |
Reddy et
al. 2003 |
53:982 |
|||
Leuconostoc
inhae |
|
? |
fermentovaná
potravina |
Kim et
al. 2003 |
53:1126 |
|||
Longispora
albida |
|
? |
půda |
Matsumoto
et al. 2003 |
53:1558 |
|||
Luteococcus
sanguinis |
|
? |
humánní
klinický materiál, krev |
Collins
et al. 2003 |
53:1891 |
|||
Macrococcus
brunensis |
|
? |
kůže lamy |
Mannerová
et al. 2003 |
53:1653 |
|||
Macrococcus
hajekii |
|
? |
kůže lamy |
Mannerová
et al. 2003 |
53:1653 |
|||
Macrococcus
lamae |
|
? |
kůže lamy |
Mannerová
et al. 2003 |
53:1653 |
|||
Marinobacter
excellens |
|
? |
mořský
sediment |
Gorshkova
et al. 2003 |
53:2077 |
|||
Marinobacter
lipolyticus |
|
? |
slaná
půda |
Martín et
al. 2003 |
53:1386 |
|||
Marinobacter
lutaoensis |
|
? |
mořské
pobřeží, horký pramen |
Shieh et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Mesonia
algae |
|
? |
mořská
zelená řasa |
Nedashkovskaya
et al. 2003 |
53:1970 |
|||
Metallosphaera
hakonensis |
<- Sulfolobus
hakonensis |
1 |
|
(Takayanagi
et al. 1996) Kurosawa et al. 2003 |
53:1608 |
|||
Methanocaldococcus
indicus |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
L'Haridon
et al. 2003 |
53:1934 |
|||
Methanoculleus
submarinus |
|
? |
hlubokomořský
sediment |
Mikucki
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Methanogenium
marinum |
|
? |
mořské
sedimenty (Aljaška) |
Chong et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Methylocella
silvestris |
|
? |
kyselá
lesní půda |
Dunfield
et al. 2003 |
53:1238 |
|||
Microbacterium
paraoxydans |
|
? |
humánní
klinický materiál, bakterémie |
Laffineur
et al. 2003 |
53:936 |
|||
Microbulbifer
elongatus |
<- Pseudomonas
elongata |
1 |
|
(Humm
1946) Yoon et al. 2003 |
53:1360 |
|||
Muricoccus
roseus |
|
? |
stavební
materiál z dětské ložnice |
Kämpfer
et al. 2003 |
53:936 |
|||
Mycobacterium
caprae |
<- Mycobacterium tuberculosis subsp. caprae |
3 |
|
(Aranaz
et al. 1999) Aranaz et al. 2003 |
53:1788 |
|||
Mycobacterium
montefiorense |
|
? |
muréna |
Levi et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Mycobacterium
pinnipedii |
|
? |
tuleň |
Cousins
et al. 2003 |
53:1312 |
|||
Nocardia
caishijiensis |
|
? |
půda |
Zhang et
al. 2003 |
53:1003 |
|||
Nocardia
puris |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Yassin et
al. 2003 |
53:1598 |
|||
Oceanicaulis
alexandrii |
|
? |
mořská
řasa (obrněnka) |
Strömpl
et al. 2003 |
53:1905 |
|||
Oceanisphaera
litoralis |
|
? |
pobřežní
písek |
Romanenko
et al. 2003 |
53:1888 |
|||
Paenibacillus
agarexedens |
<- "Bacillus
agar-exedens" |
? |
půda,
tlející rostlinný materiál |
(ex
Wieringa 1941) Uetanabaro et al. 2003 |
53:1056 |
|||
Paenibacillus
agaridevorans |
|
? |
půda,
tlející rostlinný materiál |
Uetanabaro
et al. 2003 |
53:1056 |
|||
Paenibacillus
stellifer |
|
? |
lepenka -
obalový materiál pro potraviny |
Suominen
et al. 2003 |
53:1373 |
|||
Paracoccus
yeei |
|
? |
humánní
klinický materiál |
Daneshvar
et al. 2003 |
53:936 |
|||
Parvularcula
bermudensis |
|
? |
mořská
voda |
Cho and
Giovannoni 2003 |
53:1035 |
|||
Pedobacter
cryoconitis |
|
? |
povrch
alpského ledovce |
Margesin
et al. 2003 |
53:1295 |
|||
Planococcus
maritimus |
|
? |
mořská
voda, přílivové pásmo |
Yoon et
al. 2003 |
53:2016 |
|||
Planococcus
rifietoensis |
|
? |
sirnatý
pramen, řasový porost |
Romano et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Prauserella
alba |
|
? |
slaná
půda |
Li et al.
2003 |
53:1548 |
|||
Prauserella
halophila |
|
? |
slaná
půda |
Li et al.
2003 |
53:1548 |
|||
Promicromonospora
aerolata |
|
? |
vzduch
(kaple) |
Busse et
al. 2003 |
53:1506 |
|||
Promicromonospora
vindobonensis |
|
? |
vzduch
(kaple) |
Busse et
al. 2003 |
53:1505 |
|||
Propionicimonas
paludicola |
|
? |
rostlinné
zbytky, zaplavené rýžové pole |
Akasaka
et al. 2003 |
53:1996 |
|||
Pseudoalteromonas
mariniglutinosa |
<- Pseudomonas
marinoglutinosa |
? |
mořská
řasa |
(ex
Berland et al. 1969) Romanenko et al. 2003 |
53:1108 |
|||
Pseudoalteromonas
sagamiensis |
|
? |
pobřežní
mořská voda |
Kobayashi
et al. 2003 |
53:1810 |
|||
Pseudomonas
congelans |
|
? |
tráva |
Behrendt
et al. 2003 |
53:1467 |
|||
Pseudomonas
poae |
|
? |
tráva |
Behrendt
et al. 2003 |
53:1467 |
|||
Pseudomonas
rhizosphaerae |
|
? |
trávy,
rhizosféra |
Peix et
al. 2003 |
53:2070 |
|||
Pseudomonas
trivialis |
|
? |
tráva |
Behrendt
et al. 2003 |
53:1467 |
|||
Pseudorhodobacter
ferrugineus |
<- Agrobacterium
ferrugineum |
1 |
|
(Rüger
and Höfle 1992) Uchino et al. 2003 |
53:936 |
|||
Psychrobacter
fozii |
|
? |
mořské
pobřeží, Antarktida |
Bozal et
al. 2003 |
53:1099 |
|||
Psychrobacter
luti |
|
? |
mořské
pobřeží, Antarktida |
Bozal et
al. 2003 |
53:1098 |
|||
Psychrobacter
okhotskensis |
|
? |
mořské
pobřeží |
Yumoto et
al. 2003 |
53:1988 |
|||
Ralstonia
insidiosa |
|
? |
humánní
klinický materiál, prostředí |
Coenye et
al. 2003 |
53:1079 |
|||
Rheinheimera
pacifica |
|
? |
hlubokomořská
voda |
Romanenko
et al. 2003 |
53:1976 |
|||
Rhizobium
loessense |
|
? |
kořenové
hlízy, luštěniny |
Wei et
al. 2003 |
53:1582 |
|||
Rhodocista
pekingensis |
|
? |
čistírna
odpadních vod |
Zhang et
al. 2003 |
53:1114 |
|||
Rhodococcus
tukisamuensis |
|
? |
půda |
Matsuyama
et al. 2003 |
53:1335 |
|||
Rhodoglobus
vestalii |
|
? |
vodní
nádrž (Antarktida) |
Sheridan
et al. 2003 |
53:992 |
|||
Roseomonas
gilardii subsp.
rosea |
|
? |
humánní
klinický materiál (krev) |
Han et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Roseomonas
mucosa |
|
? |
humánní
klinický materiál (krev) |
Han et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Roseospira
marina |
|
? |
pobřežní
sedimenty, slané sirnaté prameny |
Guyoneaud
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Roseospira
navarrensis |
|
? |
pobřežní
sedimenty, slané sirnaté prameny |
Guyoneaud
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Roseospira
thiosulfatophila |
|
? |
pobřežní
sedimenty, slané sirnaté prameny |
Guyoneaud
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Roseovarius
nubinhibens |
|
? |
mořská
voda |
González
et al. 2003 |
53:1268 |
|||
Saccharomonospora
paurometabolica |
|
? |
půda |
Li et al.
2003 |
53:1593 |
|||
Salinibacterium
amurskyense |
|
? |
mořská
voda |
Han et
al. 2003 |
53:2065 |
|||
Salinisphaera
shabanensis |
|
? |
slaná
voda (Rudé moře) |
Antunes
et al. 2003 |
53:1219 |
|||
Shewanella
waksmanii |
|
? |
mořští
červi |
Ivanova
et al. 2003 |
53:1476 |
|||
Schlegelella
thermodepolymerans |
|
? |
aktivovaný
kal |
Elbanna
et al. 2003 |
53:1167 |
|||
Silicibacter
pomeroyi |
|
? |
mořská
voda |
González
et al. 2003 |
53:1268 |
|||
Soehngenia
saccharolytica |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Parshina
et al. 2003 |
53:1797 |
|||
Sphingobium
amiense |
|
? |
voda-říční
sediment |
Ushiba et
al. 2003 |
53:2048 |
|||
Sphingomonas
aerolata |
|
? |
vzduch,
půda, led |
Busse et
al. 2003 |
53:1259 |
|||
Sphingomonas
aurantiaca |
|
? |
zvířený
prach, chov hovězího dobytka |
Busse et
al. 2003 |
53:1259 |
|||
Sphingomonas
faeni |
|
? |
zvířený
prach, chov hovězího dobytka |
Busse et
al. 2003 |
53:1259 |
|||
Sporomusa
aerivorans |
|
? |
termiti |
Boga et
al. 2003 |
53:1403 |
|||
Sporosarcina
macmurdoensis |
|
? |
porost
cyanobakterií (Antarktida) |
Reddy et
al. 2003 |
53:1366 |
|||
Sporotomaculum
syntrophicum |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Qiu et
al. 2003 |
53:936 |
|||
Staphylococcus
equorum subsp.
linens |
|
? |
složka
startovací kultury pro přípravu sýru |
Place et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Staphylococcus
nepalensis |
|
? |
koza |
Spergser
et al. 2003 |
53:2010 |
|||
Sterolibacterium
denitrificans |
|
? |
bioreaktor
na zpracování odpadu |
Tarlera
and Denner 2003 |
53:1090 |
|||
Streptacidiphilus
albus |
|
? |
kyselá
půda, stelivo |
Kim et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptacidiphilus
carbonis |
|
? |
kyselá
půda, stelivo |
Kim et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptacidiphilus
neutrinimicus |
|
? |
kyselá
půda, stelivo |
Kim et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptococcus
oligofermentans |
|
? |
humánní
klinický materiál (dentální plaky, sliny) |
Tong et
al. 2003 |
53:1103 |
|||
Streptomonospora
alba |
|
? |
slaná
půda |
Li et al.
2003 |
53:1424 |
|||
Streptomyces
aureus |
|
? |
půda |
Manfio et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptomyces
laceyi |
|
? |
půda |
Manfio et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptomyces
luridiscabiei |
|
? |
brambory,
infekce |
Park et
al. 2003 |
53:2053 |
|||
Streptomyces
luteireticuli |
<- Streptoverticillium
luteoreticuli |
? |
|
(ex Katoh
and Arai 1957) Hatano et al. 2003 |
53:1528 |
|||
Streptomyces
niveiciscabiei |
|
? |
brambory,
infekce |
Park et
al. 2003 |
53:2053 |
|||
Streptomyces
puniciscabiei |
|
? |
brambory,
infekce |
Park et
al. 2003 |
53:2053 |
|||
Streptomyces
sanglieri |
|
? |
půda |
Manfio et
al. 2003 |
53:1219 |
|||
Streptomyces
yatensis |
|
? |
zásaditá
půda |
Saintpierre
et al. 2003 |
53:1219 |
|||
Sulfurimonas
autotrophica |
|
? |
hlubokomořské
hydrotermální sedimenty |
Inagaki
et al. 2003 |
53:1805 |
|||
Teichococcus
ludipueritiae |
|
? |
stavební
materiál z dětské ložnice |
Kämpfer
et al. 2003 |
53:936 |
|||
Tepidibacter
thalassicus |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Slobodkin
et al. 2003 |
53:1133 |
|||
Tepidimonas
aquatica |
|
? |
nádrž na
horkou vodu |
Freitas
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Tepidiphilus
margaritifer |
|
? |
bioreaktor,
zpracování odpadní vody |
Manaia et
al. 2003 |
53:1409 |
|||
Thermomonas
brevis |
|
? |
biorektor
(denitrifikace pitné vody) |
Mergaert
et al. 2003 |
53:1966 |
|||
Thermomonas
fusca |
|
? |
biorektor
(denitrifikace pitné vody) |
Mergaert
et al. 2003 |
53:1965 |
|||
Thermomonas
hydrothermalis |
|
? |
horký
pramen |
Alves et
al. 2003 |
53:936 |
|||
Thialkalivibrio
nitratireducens |
|
? |
sodné
jezero |
Sorokin
et al. 2003 |
53:1783 |
|||
Tindallia
californiensis |
|
? |
sedimenty,
jezero Mono Lake |
Pikuta et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Tistrella
mobilis |
|
? |
odpadní
voda |
Shi et
al. 2003 |
53:936 |
|||
Tsukamurella
spumae |
|
? |
aktivované
kaly |
Nam et
al. 2003 |
53:1701 |
|||
Vibrio
fortis |
|
? |
mořské
prostředí, vodní živočichové |
Thompson
et al. 2003 |
53:1499 |
|||
Vibrio
hepatarius |
|
? |
garnát |
Thompson
et al. 2003 |
53:1500 |
|||
Vibrio
pacinii |
|
? |
garnát,
mořské ryby chované v sádkách |
Gomez-Gil
et al. 2003 |
53:1572 |
|||
Vibrio
superstes |
|
? |
mořští
plži (ušeň) |
Hayashi
et al. 2003 |
53:1816 |
|||
Vibrio
tasmaniensis |
|
? |
losos |
Thompson
et al. 2003 |
53:1701 |
|||
Vitellibacter
vladivostokensis |
|
? |
sumýš |
Nedashkovskaya
et al. 2003 |
53:1285 |
|||
Vulcanithermus
mediatlanticus |
|
? |
hlubokomořský
hydrotermální průduch |
Miroshnichenko
et al. 2003 |
53:1147 |
|||
Wautersia
respiraculi |
<-
Ralstonia respiraculi |
? |
|
(Coenye
et al. 2003) Vaneechoutte et al. 2004 |
54:325 |
|||
Zooshikella
ganghwensis |
|
? |
sediment |
Yi et al.
2003 |
53:1016 |
|||
Charakteristika
rizikových skupin 1 až 3 dle patogenity mikroorganismů
1 Mikroorganismy, u nichž je malá pravděpodobnost, že vyvolají onemocnění lidí nebo zvířat.
2 Mikroorganismy, které mohou být příčinou onemocnění lidí a/nebo zvířat. Existuje proti nim obvykle účinná profylaxe a způsobená onemocnění jsou léčitelná.
3 Mikroorganismy, které vyvolávají vážná onemocnění lidí a/nebo zvířat. Existuje proti nim účinná profylaxe a způsobená onemocnění jsou léčitelná.
? Údaje o patogenitě nejsou známy.