Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2004; 13(10-11):468-479.

 

Novinky v taxonomii bakterií (č. 11)

Zdena Páčová, Vlastimil Štětina

 

      V taxonomickém okénku č. 11 předkládáme  v tabulce I přehled nových taxonů prokaryot (Bacteria, Archaea), validně publikovaných v International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM) č. 4, 5 a 6 v r. 2003 a uvedených na validačních listech č. 92, 93 a 94 v témže časopise. Uvedeny jsou rovněž nové kombinace, které vznikly přeřazením dříve validně publikovaného druhu do nového rodu (původní jméno se stává synonymem). U nových kombinací neuvádíme informace týkající se výskytu.

     V textové části jsou uvedeny základní informace pouze k nově popsaným klinicky významným taxonům z tabulky I. Údaje zde uvedené mají informační charakter, se záměrem poukázat na novinky v taxonomii bakterií, které se vážou k problematice humánní klinické bakteriologie.

 

Základní informace k nově popsaným klinicky významným bakteriálním druhům

 

Achromobacter insolitus, A. spanius

      Gramnegativní tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující, nefermentující, nehemolytické, kolonie bílé až světle hnědé, příbuzné druhu Alcaligenes faecalis.

Význačné vlastnosti

      kataláza, oxidáza  pozitivní

      ureáza, β-galaktosidáza, β-glukuronidáza, α,β-glukosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza, DNáza, arginin dihydroláza, lysin dekarboxyláza, ornithin dekarboxyláza negativní

      netvoří kyselinu z glukózy, maltózy, fruktózy, xylózy a adonitolu, indol

      hydrolyzují Tween 80

nehydrolyzují želatinu, eskulin, škrob

neredukují nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (krev, rána, moč)

Srovnávací materiál

      Achromobacter insolitus CCM 7182 (typová kultura)

      Achromobacter spanius CCM  7183 (typová kultura)

 

Základní rozlišující testy

                                                                                                         ACT      DNT      Glu       Aco

Achromobacter insolitus                                                                        +           -           -           +

Achromobnacter spanius                                                                       -           -           -           -

Achromobacter denitrificans                                                                  V          +           -           +

Achromobacter piechaudii                                                                     V          -           -           +

Achromobacter xylosoxidans                                                                  -           +          +          +

 

 

Acinetobacter parvus

      Gramnegativní tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující, nefermentující, nehemolytické, na rozdíl od ostatních acinetobakterů tvoří na agarových mediích malé kolonie a roste na etanolu a acetátu jako jediném zdroji C.

Význačné vlastnosti

      kataláza pozitivní

      netvoří kyselinu z glukózy

      roste při 35 °C

      neroste při 42 °C

      nehydrolyzuje želatinu

      neutilizuje citrát, akonitát, fenylacetát, malát, malonát

Výskyt

      humánní klinický materiál (ucho, oko, čelo, kůže), veterinární klinický materiál (pes, ucho)

Srovnávací materiál

      Acinetobacter parvus CCM 7030 (typová kultura)

 

Rozlišující testy

      sekvencování genu pro 16S rRNA

      AFLP

      ARDRA

 

 

Actinomyces nasicola

Grampozitivní, krátké difteroidní tyčky, větvené i kokoidní formy se mohou vyskytovat, fakultativně anaerobní, lépe rostou za anaerobních podmínek, nesporulující, nepigmentující, konečný produkt metabolismu glukózy je kyselina octová, mléčná , jantarová (popis na základě jednoho kmene).

Význačné vlastnosti

      β-glukosidáza, β-galaktosidáza, leucin arylamidáza, N-acetyl-β-glukominidáza pozitivní

      kataláza, ureáza, lecitináza, lipáza, alkalická a kyselá fosfatáza, α-galaktosidáza, β-glukuronidáza, pyrrolidonyl arylamidáza negativní

      tvoří kyselinu z fruktózy, celobiózy

      netvoří kyselinu z glukózy, arabinózy, laktózy, manózy, ribózy, sacharózy, trehalózy, xylózy, salicinu, manitolu

      nehydrolyzuje želatinu, škrob, eskulin

Výskyt

      humánní klinický materiál (nos)

 

Základní rozlišující testy

                                                                                                         LAC      SUC     AGA     BGA

Actinomyces nasicola                                                                            -           -           -           +

Actinomyces hordeovulneris                                                                   +          +          +          +

Actinomyces marimammalium                                                               V          -           -           -

 

 

 

Actinomyces oricola

      Grampozitivní tyčky až vlákna, někdy větvená, fakultativně anaerobní až anaerobní, nesporulující, nehemolytické, nepigmentující, konečný produkt metabolismu glukózy je kyselina octová, mléčná , jantarová (popis na základě jednoho kmene).

Význačné vlastnosti

      α-galaktosidáza, α, β-glukosidáza, pyrazinamidáza, leucin arylamidáza pozitivní

      kataláza, ureáza, lipáza, lecitináza, arginin dihydroláza, β-glukuronidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza negativní

      tvoří kyselinu z celobiózy, fruktózy, sacharózy

      netvoří kyselinu z laktózy, L-arabinózy, manitolu, melibiózy, melezitózy, trehalózy, D-xylózy a sorbitolu, indol

      hydrolyzuje eskulin

      nehydrolyzuje želatinu, škrob

      neredukuje nitráty

Výskyt

      dentální absces

 

Základní rozlišující testy

                                                                                             MLZ      TRE     ARG    APPA    BGA

Actinomyces oricola                                                                  -           -           -           +           -

Actinomyces denticolens                                                           V          +           -           V          +

Actinomyces naeslundii                                                             -           V          -           -           +

Actinomyces slackii                                                                  -           +           -           -           +

Actinomyces urogenitalis                                                           +          +          +          +          +

Actinomyces viscosus                                                               -           -           -           +          +      

 

 

Alistipes finegoldii

      Grampozitivní tyčky, zakřivené, tvořící i dlouhá vlákna, striktně anaerobní, nesporulující, slabě hemolytické, růstově náročné, po 4-10 denní inkubaci kolonie na médiích s hemolyzovanou krví světle hnědé až červenohnědé, hlavní metabolický produkt v PYG bujonu je kyselina jantarová, fenotypově podobné skupině Bacteroides fragilis a druhům rodu Porphyromonas.

Význačné vlastnosti

      alkalická a kyselá fosfatáza, α,β-galaktosidáza, α-glukosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza pozitivní

      kataláza, lecitináza, lipáza, leucin arylamidáza, β-glukosidáza, β-glukuronidáza negativní

      hydrolyzuje želatinu

      tvoří indol

      redukuje nitráty

      rezistentní k vankomycinu, kanamycinu, kolistinu

Výskyt

      humánní klinický materiál (stolice, v 41% izolován z apendicitidy u dětí)

 

Základní rozlišující testy

                                                                                            BIL20     PIG      NGA     AGA     BGA

Alistipes finegoldii                                                                     +          +          +          +          +

Alistipes putredinis                                                                    -           -           -           -           -

 

 

Brevibacterium luteolum (popsáno jako B. lutescens)

      Grampozitivní, difteroidní tyčky, aerobní, nesporulující, nepohyblivé, netvoří cyklus tyčka-kok, žlutě pigmentující.

Význačné vlastnosti

      kataláza, pyrrolidonyl peptidáza, leucin arylamidáza pozitivní

      ureáza, pyrazinamidáza negativní

      netvoří kyselinu z cukrů

      roste v 10% NaCl

      hydrolyzuje želatinu, kasein

      nehydrolyzuje eskulin, tyrozin, xantin

      neredukuje nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (peritoneální tekutina, ucho), prostředí

Srovnávací materiál

      Brevibacterium luteolum  CCM 7149 (typová kultura)

 

Základní rozlišující testy 

                                                                                 C20      NO3      Pha      NGA     PYR      PYZ

Brevibacterium luteolum                                                +           -           +          +          +          +

Brevibacterium casei                                                     +          V          +           -           V          +

Brevibacterium epidermidis                                            +          V          -           +           -           +

Brevibacterium iodinum                                                 +          +          +           -           -           +

Brevibacterium linens                                                    +          +        +sl.         -           -           +

Brevibacterium mcbrellneri                                             -           -           +          +           -           -

Brevibacterium otitidis                                                   -           -           -           -           +          +

Brevibacterium paucivorans                                            -           -           +          V          -           -

 

Burkholderia cenocepacia

      Gramnegativní tyčky, aerobní, nesporulující, pohyblivé, většinou nehemolytické, některé kmeny žlutě pigmentující, dříve Burkholderia cepacia genomovar III.

Význačné vlastnosti

      kataláza, oxidáza (slabě) pozitivní

      DNáza, arginin dihydroláza negativní

      lysin dekarboxyláza pozitivní nebo negativní (podle použité metody)

      tvoří kyselinu z glukózy

      netvoří kyselinu z rhamnózy, rafinózy

      hydrolyzuje Tween 80

      nehydrolyzuje eskulin, škrob

Výskyt

      pacienti s cystickou fibrózou (sputum), jiný klinický materiál, rhizosféra zemědělských plodin

Srovnávací materiál

      Burkholderia cenocepacia CCM 4899 (typová kultura)

Rozlišující testy

      PCR

      DNA-DNA hybridizace

 

Cetobacterium somerae

      Gramnegativní tyčky, mikroaerotolerantní, nesporulující, nepigmentující, hlavním produktem metabolizmu glukózy je  kyselina octová.

Význačné vlastnosti

      α-,β-galaktosidáza, alkalická a kyselá fosfatáza pozitivní

      kataláza, lecitináza, lipáza negativní

      nehydrolyzuje želatinu

      redukuje nitráty

      tvoří indol

      citlivý ke kanamycinu, kolistin sulfátu, cefoxitinu, klindamycinu, metronidazolu

      rezistentní k ampicilinu, penicilinu G,  trimetoprim/sulfametoxazolu, vankomycinu, 20% žluči

Výskyt

      humánní klinický materiál (stolice)

Rozlišující testy

      sekvencování genu pro 16S rRNA

      DNA-DNA hybridizace

      analýza mastných kyselin

      enzymatické aktivity (API ZYM, AN MicroPlate)

 

Clostridium bolteae

      Grampozitivní tyčky, striktně anaerobní, sporulující, nepigmentující, sacharolytické, hlavními produkty metabolismu glukózy jsou kyselina octová a mléčná, nový druh ve fylogenetické skupině „Clostridium coccoides“, nejblíže příbuzný druhu Clostridium clostridiiforme.

Význačné vlastnosti

      kyselá fosfatáza, α-,β-galaktosidáza, α-glukosidáza pozitivní

      kataláza, ureáza, lecitináza, lipáza negativní

      tvoří kyselinu z většiny cukrů

      netvoří kyselinu z manitolu, inulinu, laktózy, melibiózy, ribózy a  salicinu, indol

      nehydrolyzuje eskulin, želatinu

      neredukuje nitráty

      citlivý ke kanamycinu, kolistin sulfátu

      rezistentní k ampicilinu a obvykle k piperacilinu, tikarcilinu, vankomycinu

Výskyt

      humánní klinický materiál (stolice, krev, intraabdominální absces)

Rozlišovací metody

      sekvencování genu pro 16S rRNA

      DNA-DNA hybridizace

      analýza mastných kyselin

      enzymatické aktivity (API ZYM, Rapid ID ANAII)

 

 

 

Corynebacterium atypicum

      Grampozitivní, difteroidní tyčky, fakultativně anaerobní, nesporulující, nepohyblivé, nehemolytické, alipofilní, neobsahuje  mykolové kyseliny (popis na základě jednoho kmene).

Význačné vlastnosti

      kataláza, β-glukuronidáza, leucin arylamidáza pozitivní

      ureáza, alkalická a kyselá fosfatáza, α-,β-glukosidáza, α-,β-galaktosidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza, pyrrolidonyl arylamidáza, pyrazinamidáza negativní

      tvoří kyselinu z glukózy, maltózy, ribózy, sacharózy

      netvoří kyselinu z laktózy, D-xylózy, manitolu

      roste v 7,5% NaCl

      neroste v 10% NaCl

      neredukuje nitráty

      netvoří acetoin

Výskyt

      humánní klinický materiál

 

Základní rozlišující testy

                                                                                             GLU     aPHS    BGR      PYZ      ESL

Corynebacterium atypicum                                                         +          +           -           -           -

Corynebacterium amycolatum                                                    +           -           +          +           -

Corynebacterium glucuronolyticum                                             +          +          +           -           V

Corynebacterium kroppenstedtii                                                 +           -           +          V          +

Corynebacterium mastitidis                                                        -           -           +          +           -

 

 

Dialister invisus

Gramnegativní kokobacily, striktně anaerobní, nesporulující, nepohyblivé, asacharolytické, pomalu rostoucí, v tekutých médiích pouze slabý zákal, stimulace růstu s 1% karbohydrátů.

Význačné vlastnosti

      kataláza, ureáza, arginin dihydroláza negativní

      neroste ve 20% žluči

nehydrolyzuje eskulin

      netvoří indol

Výskyt

      dutina ústní (infekce zubní dřeně a ozubice)

Rozlišovací testy

      sekvencování genu pro 16S rRNA

      SDS-PAGE

      detekce enzymů (Rapid ID 32A)

 

Kerstersia gyiorum

Gramnegativní tyčky, kokoidní, aerobní, nesporulující, nefermentující, nehemolytické, kolonie bílé až světle hnědé, příbuzné rodům Alcaligenes, Achromobacter, Bordetella  a Pigmentiphaga.

Význačné vlastnosti

      kataláza pozitivní

      oxidáza, ureáza, arginin dihydroláza, lysin dekarboxyláza, ornithin dekarboxyláza, DNáza, β-galaktosidáza negativní

      roste při 42 °C

      nehydrolyzuje želatinu, eskulin, škrob

      neredukuje nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (stolice, vřed, sputum)

Srovnávací materiál

      Kerstersia gyiorum CCM 7184 (typová kultura)

 

 

 

 

Základní rozlišující testy 

                                                                                  OXI       C42       Glu       Cpr       Adi       ESL

Kerstersia gyiorum                                                         -           +           -           +           -           -

Alcaligenes faecalis                                                      +          +           -           +           -           -

Achromobacter denitrificans                                          +          +           -           +          +          +

Achromobacter piechaudii                                             +          +           -           -           +           -

Achromobacter xylosoxidans                                          +          +          +          +          +          +

Bordetella bronchiseptica                                              +          +           -           V          +           -

Bordetella hinzii                                                            +          +           -           +          +          +

Bordetella holmesii                                                        +           -           -           -           -           -

Bordetella pertussis                                                      +           -           -           -           -           -

Bordetella petrii                                                             +         NT          -           +          +           -

Bordetella trematum                                                      -           +           -           -           +          +

 

 

Luteococcus sanguinis

      Grampozitivní koky, fakultativně anaerobní (popis na základě jednoho kmene).

Význačné vlastnosti

      kataláza, alkalická fosfatáza, α-,β-galaktosidáza, α-,β-glukosidáza, leucin arylamidáza, pyrrolidonyl arylamidáda, pyrazinamidáza pozitivní

      ureáza, β-glukuronidáza, N-acetyl-β-glukosaminidáza negativní

      tvoří kyselinu z glukózy, maltózy, laktózy, sacharózy, manitolu

      netvoří kyselinu z D-xylózy, ribózy

      hydrolyzuje želatinu, eskulin

      netvoří acetoin

      neredukuje nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (krev)

 

 

Základní rozlišující testy

                                                                                                         LAC     BGR     PYR      NO3

Luteococcus sanguinis                                                                          +           -           +          +

Luteococcus japonicus                                                                          -           -           +           -

Luteococcus peritonei                                                                           +          +           -           +

 

 

Microbacterium paraoxydans

      Grampozitivní koryneformní tyčky, nesporulující, pohyblivé, aerobní, kolonie tvoří žlutý pigment, nejblíže příbuzné druhu Microbacterium oxydans.

Význačné vlastnosti

      kataláza, DNáza, α-glukosidáza, leucin arylamidáza pozitivní

      oxidáza, β-glukosidáza, β-glukuronidáza negativní

      tvoří kyselinu z glukózy, sacharózy, maltózy, galaktózy, fruktózy, manózy, manitolu

      netvoří kyselinu ze salicinu

      hydrolyzuje želatinu, kasein, eskulin (opožděně)

      nehydrolyzuje tyrozin

Výskyt

      humánní klinický materiál (krev, bronchiální aspirát), rostlinný materiál

 

Základní rozlišující testy

                                                                                                         C40      SAL      BGL      Lac

Microbacterium paraoxydans                                                                  +           -           -           +

Microbacterium oxydans                                                                         -           +          +           -

 

 

 

Nocardia puris

      Grampozitivní hyfy s nepravidelným větvením, vrůstající do agaru a rozpadající se na tyčky, rozmezí růstu (22 – 45 °C), nejblíže  příbuzné druhům Nocardia abscessus, N. cyriacigeorgica a N. farcinica (popis na základě jednoho kmene).

Význačné vlastnosti

      arginin dihydroláza, ornithin dekarboxyláza negativní

      utilizuje acetát, citrát, glukózu, maltózu, sacharózu, manitol, sorbitol

      neutilizuje laktát, acetamid, adonitol, celobiózu, galaktózu, laktózu, melezitózu, rhamnózu, trehalózu, xylózu

      hydrolyzuje eskulin

nehydrolyzuje želatinu, kasein, tyrozin, xantin

Výskyt

      humánní absces

 

 

Základní rozlišující testy 

                                                                                 ESL       Cit        Gal       Mlt        Tre       Man

Nocardia puris                                                              +          +           -           +           -           +

Nocardia abscessus                                                      -           +           -           +          +           -

Nocardia asteroides                                                      +           -           -           -           -           -

Nocardia brasiliensis                                                     +          +          +          +          +        +sl.

Nocardia cyriacigeorgica                                                +           -           -           -           -           -

Nocardia farcinica                                                         +           -           -           +          +           -

Nocardia otitidisaviarum                                                 +           -           -           -         +sl.        +

Nocardia paucivorans                                                     -           -           -           -           +           -

Nocardia transvalensis                                                   -           +          +          +          +          +

Nocardia vaccinii                                                           -           +          +           -           +           -

Nocardia veterana                                                         +           -           -           -           -           -

 

 

Paracoccus yeei (popsán jako P. yeeii)

      Gramnegativní diplokoky, kokotyčky, často s vakuolami, aerobní, nesporulující, nepohyblivé, nehemolytické, kolonie mukózní až extrémně mukózní, první druh rodu Paracoccus, izolovaný z klinického materiálu (dříve CDC skupina EO-2), fenotypově podobný druhům Psychrobacter immobilis, Paracoccus denitrificans, P. versutus, P. aminophilis a P. solventivorans.

Význačné vlastnosti

      kataláza, oxidáza, ureáza pozitivní

      lysin dekarboxyláza negativní

      tvoří kyselinu z glukózy, laktózy, xylózy

      netvoří kyselinu ze sacharózy, indol

roste na MacConkeyově agaru

nehydrolyzuje želatinu, eskulin

redukuje nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (vřed, rána, krev, kůže, oko, ucho, cerebrospinální tekutina)

Srovnávací materál

      Paracoccus yeei  CCM 7173  (typová kultura)

Rozlišovací metody

      sekvencování genu pro 16S rRNA

      analýza mastných kyselin

 

Ralstonia insidiosa

      Gramnegativní tyčky, aerobní, nesporulující, nefermentující, pohyblivé, rostou na BCSA, dříve Ralsonia pickettii – like.

Význačné vlastnosti

      kataláza, oxidáza, lipáza, fosfatáza, pyrrolidonyl aminopeptidáza pozitivní

      lysin dekarboxyláza, arginin dihydroláza, α-,β-glukosidáza  negativní

      netvoří kyselinu z glukózy, laktózy a sacharózy, indol

      nehydrolyzuje želatinu

      redukuje nitráty

Výskyt

      humánní klinický materiál (sputum), prostředí (aktivovaný kal, půda, voda)

Srovnávací materiál

      Ralstonia insidiosa CCM 7174 (typová kultura)

 

Základní rozlišující testy 

                                                                                 NO3      URE      Ara       Man       Cit       NGA

Ralstonia insidiosa                                                        +          V          -           -           +           -

Ralstonia eutropha                                                        +           -           -           -           +          +

Ralstonia gilardii                                                            -           -           -           -           -           -

Ralstonia mannitolilytica                                                 -           +          +          +          +          +

Ralstonia paucula                                                          -           +           -           -           +           -

Ralstonia picketii                                                          +          V          +           -           +          +

Ralstonia solanacearum                                                +           -           -           -           +           -

 

 

Roseomonas gilardii subsp. rosea,  R. mucosa

      Gramnegativní kokotyčky, aerobní, nefermentující, kolonie jsou mukózní (silně mukózní u druhu R. mucosa), růžové, neabsorbují dlouhovlnné UV záření, nevyžadují metanol, oxidáza variabilní, biochemickými reakcemi téměř neodlišitelné od druhů R. gilardii subsp. gilardii a R. cervicalis, oba druhy bývají nejčastěji izolovanými druhy rodu Roseomonas.

Význačné vlastnosti

      kataláza pozitivní

      β-galaktosidáza, arginin dihydroláza negativní

netvoří kyselinu z glukózy, indol

neutilizují  manózu, manitol, N-acetylglukosamin, maltózu, kaprát, fenylacetát

utilizují malát, citrát

neredukují nitráty

citlivé na amikacin, ciprofloxacin, často na imipenem, tikarcilin/klav. kyselinu, R. gilardii subsp. rosea na ampicilin

rezistentní na cefepim, ceftazidim, často na trimetoprim/sulfametoxazol, R. mucosa na ampicilin

Výskyt

      humánní klinický materiál (krev)

Srovnávací materiál

      Roseomonas gilardii subsp. rosea CCM 7178 (typová kultura)

      Roseomonas mucosa CCM 7177 (typová kultura)

 

Základní rozlišující testy

                                                                                                         ESL      NO3      GLY      GAL

Roseomonas gilardii subsp. rosea                                                           -           -          NT        NT

Roseomonas mucosa                                                                            -           -          NT        NT

Roseomonas cervicalis                                                                          -           -           -           -

Roseomonas fauriae                                                                             +          +          +          +

Roseomonas gilardii subsp. gilardii                                                         -           -           +          V

 

 

Streptococcus oligofermentans

      Grampozitivní koky v krátkých řetízcích, nesporulující, nepohyblivé, fakultativně anaerobní, a-hemolytické, kolonie na BHI agaru tmavě žluté, patří do „mitis“ skupiny streptokoků, nejblíže příbuzný druh Streptococcus sinensis.

Význačné vlastnosti

      kataláza, β-galaktosidáza, arginin dihydroláza negativní

      tvoří kyselinu z glukózy, sacharózy, manózy, maltózy

      netvoří kyselinu z arabinózy, melibiózy, celobiózy, amygdalinu, ribózy, manitolu, salicinu a sorbitolu, acetoin

      hydrolyzuje hippurát

      nehydrolyzuje eskulin

Výskyt

      humánní klinický materiál (sliny, dentální plak)

 

 

Základní rozlišující testy (od některých příbuzných druhů „mitis“ skupiny)

                                                                                 ARG      HIP      TRE      MLB     BGA    aPHS

Streptococcus oligofermentans                                       -           +          V          -           -           V

Streptococcus infantis                                                   -           -           -           -           +           -

Sterptococcus mitis                                                       -           -           -                   V          V

Streptococcus oralis                                                      -           -                            V          V

Streptococcus pneumonie                                             V          -           +           -           -           -

Streptococcus sanguinis                                               +           -           +          V          +          V

Streptococcus  sinensis                                                +           -           +           -           -           -

 

 

Wautersia respiraculi (popsána jako Ralstonia respiraculi)

      Gramnegativní tyčky, nesporulující, aerobní, nefermentující, nerostou na BCSA.

Význačné vlastnosti

      kataláza, oxidáza, pyrrolidonyl aminopeptidáza pozitivní

      ureáza , lipáza, β-galaktosidáza, lysin dekarboxyláza negativní

      netvoří kyselinu z glukózy, indol

      utilizuje kaprát, glukonát

      neutilizuje glukózu, arabinózu, manózu, manitol, N-acetylglukosamin, maltózu, citrát, fenylacetát

      nehydrolyzuje želatinu

Výskyt

      respirační trakt pacientů s cystickou fibrózou

Srovnávací materiál

      Wautersia respiraculi CCM 7175 (typová kultura)

 

Základní rozlišující testy 

                                                                                             NO3      URE     NGA       Cit       Pha

Wautersia respiraculi                                                                 V          -           -           -           -

Ralstonia eutropha                                                                    +           -           +          +          +

Ralstonia gilardii                                                                        -           -           -           -           V

Ralstonia insidiosa                                                                    +          V          -           +          +

Ralstonia mannitolilytica                                                             -           +          +          +           -

Ralstonia paucula                                                                      -           +           -           +          +

Ralstonia pickettii                                                                     +          +          +          +          +

 

 

 

Vysvětlivky:

Aco = utilizace akonitátu; ACT = růst na acetamidu; Adi = utilizace adipátu; AGA = α-galaktosidáza; aPHS=alkalická fosfatáza; APPA = alanin fenylalanin prolin arylamidáza; Ara = utilizace arabinózy; ARG = arginin dihydroláza; BGA = β-galaktosidáza; BGL = β-glukosidáza; BGR = β-glukuronidáza;  BIL20 = růst ve 20% žluči; Cit = utilizace citrátu; Cpr = utilizace kaprátu; C20 = růst při 20 °C; C40 = růst při 40 °C; C42 = růst při 42 °C; DNT = denitrifikace; ESL = hydrolýza eskulinu; GAL = kyselina z galaktózy; Gal = utilizace galaktózy; GLU = kyselina z glukózy; Glu = utilizace glukózy; GLY = kyselina z glycerolu; HIP = hydrolýza hippurátu; LAC = kyselina z laktózy; Lac = utilizace laktózy; LAR = leucin arylamidáza; Man = utilizace manitolu; MLB = kyselina z melibiózy; Mlt = utilizace maltózy; MLZ = kyselina z melezitózy; NGA = N-acetyl-β-glukosaminidáza; NO3 = redukce nitrátů; OXI = oxidáza; Pha = utilizace fenylacetátu; PIG = tvorba pigmentu; PYR = pyrrolidonyl arylamidáza; PYZ = pyrazinamidáza; SAL = kyselina ze salicinu; SUC = kyselina ze sacharózy;  Suc = utilizace sacharózy; TRE = kyselina z trehalózy; Tre = utilizace trehalózy; URE = ureáza; + = 90-100% pozitivních reakcí; +sl. = slabě pozitivní reakce; V = 20-80% pozitivních reakcí; - = 0-10% pozitivních reakcí; NT = netestováno; CCM = Česká sbírka mikroorganismů, Brno

 

Zdena Páčová

Vlastimil Štětina

Česká sbírka mikroorganismů

Přírodovědecká fakulta

Masarykovy univerzity, Brno

 

Tabulka I: NOVÉ DRUHY PROKARYOT VČETNĚ NOMENKLATORICKÝCH ZMĚN (červenec 2003 - prosinec 2003)

 

 

 

 

 

 

 

 

Druh

Původní označení

Riziková

 

Výskyt

Autor

Citace v IJSEM

 

skupina

 

 

Acinetobacter baylyi

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:960

Acinetobacter bouvetii

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:961

Acinetobacter gerneri

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:961

Acinetobacter grimontii

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:961

Acinetobacter parvus

 

?

humánní klinický materiál, pes

Nemec et al. 2003

53:1566

Acinetobacter tandoii

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:962

Acinetobacter tjernbergiae

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:961

Acinetobacter towneri

 

?

aktivovaný kal

Carr et al. 2003

53:961

Actinomyces nasicola

 

?

humánní klinický materiál

Hall et al. 2003

53:1448

Actinomyces oricola

 

?

humánní klinický materiál

Hall et al. 2003

53:1518

Aeromicrobium marinum

 

?

mořská voda

Bruns et al. 2003

53:1922

Agreia pratensis

<- Subtercola pratensis

?

 

(Behrendt et al. 2002) Schumann et al. 2003

53:2043

Agromyces albus

 

?

rostlinný materiál

Dorofeeva et al. 2003

53:1438

Achromobacter denitrificans

<- Alcaligenes denitrificans

2

 

(Rüger and Tan 1983) Coenye et al. 2003

53:1829

Achromobacter insolitus

 

?

humánní klinický materiál, prostředí

Coenye et al. 2003

53:1823

Achromobacter spanius

 

?

humánní klinický materiál, prostředí

Coenye et al. 2003

53:1823

Algoriphagus ratkowskyi

 

?

mořský led, slané jezero (Antarktida)

Bowman et al. 2003

53:1352

Alicyclobacillus pomorum

 

?

zkažený ovocný džus

Goto et al. 2003

53:1542

Alicyclobacillus sendaiensis

 

?

půda

Tsuruoka et al. 2003

53:1084

Alistipes finegoldii

 

?

humánní materiál

Rautio et al. 2003

53:1701

Alistipes putredinis

<- Bacteroides putredinis

2

 

(Weinberg et al. 1937) Rautio et al. 2003

53:1701

Alkaliphilus crotonatoxidans

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Cao et al. 2003

53:973

Alkanindiges illinoisensis

 

?

kontaminovaná půda, ropné pole

Bogan et al. 2003

53:1394

Alteromonas marina

 

?

mořská voda

Yoon et al. 2003

53:1629

Amycolatopsis balhimycina

 

?

půda

Wink et al. 2003

53:935

Amycolatopsis kentuckyensis

 

?

kůň

Labeda et al. 2003

53:1603

Amycolatopsis keratiniphila subsp. nogabecina

?

půda

Wink et al. 2003

53:935

Amycolatopsis lexingtonensis

 

?

kůň

Labeda et al. 2003

53:1603

Amycolatopsis pretoriensis

 

?

kůň

Labeda et al. 2003

53:1605

Amycolatopsis tolypomycina

 

?

půda

Wink et al. 2003

53:935

Amycolatopsis vancoresmycina

 

?

půda

Wink et al. 2003

53:935

Anaerolinea thermophila

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Sekiguchi et al. 2003

53:1850

Anoxybacillus gonensis

 

?

horké prameny

Belduz et al. 2003

53:1319

Anoxynatronum sibiricum

 

?

sodné jezero

Garnova et al. 2003

53:1219

Arenibacter troitsensis

 

?

mořský sediment

Nedashkovskaya et al. 2003

53:1289

Arthrobacter gandavensis

 

?

hovězí dobytek

Storms et al. 2003

53:1883

Arthrobacter koreensis

 

?

půda

Lee et al. 2003

53:1280

Aurantimonas coralicida

 

?

mořský korál

Denner et al. 2003

53:1120

Bacillus aeolius

 

?

mořské prostředí

Gugliandolo et al. 2003

53:1701

Bacillus aquimaris

 

?

mořská voda v pásmu přílivu

Yoon et al. 2003

53:1302

Bacillus krulwichiae

 

?

půda kontaminovaná aromatickými sloučeninami

Yumoto et al. 2003

53:1536

Bacillus marisflavi

 

?

mořská voda v pásmu přílivu

Yoon et al. 2003

53:1302

Balnearium lithotrophicum

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Takai et al. 2003

53:1953

Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum

?

faeces selete

Zhu et al. 2003

53:1622

Bosea minatitlanensis

 

?

kal z bioreaktoru

Ouattara et al. 2003

53:1250

Brachybacterium muris

 

?

laboratorní myš, játra

Buczolits et al. 2003

53:1959

Brevibacterium luteolum

<- Brevibacterium lutescens

?

humánní klinický materiál, prostředí

Wauters et al. 2003 corrig. list editor 2004

53:1324

Brumimicrobium glaciale

 

?

mořský led, sediment (Antarktida)

Bowman et al. 2003

53:1352

Burkholderia cenocepacia

 

?

humánní klinický materiál

Vandamme et al. 2003

53:935

Burkholderia sordidicola

 

?

houby, infekce

Lim et al. 2003

53:1635

Caenibacterium thermophilum

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Manaia et al. 2003

53:1380

Caldilinea aerophila

 

?

horké sirnaté prameny

Sekiguchi et al. 2003

53:1850

Caldisphaera lagunensis

 

?

kyselý horký pramen

Itoh et al. 2003

53:1153

Cetobacterium somerae

 

?

humánní materiál (stolice)

Finegold et al. 2003

53:1219

Clostridium amygdalinum

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Parshina et al. 2003

53:1797

Clostridium bolteae

 

?

humánní materiál

Song et al. 2003

53:935

Clostridium bowmanii

 

?

jezero (Antarktida)

Spring et al. 2003

53:1027

Clostridium caminithermale

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Brisbarre et al. 2003

53:1047

Clostridium estertheticum subsp. laramiense

<- Clostridium laramiense

1

 

(Kalchayanand et al. 1993) Spring et al. 2003

53:1028

Clostridium frigoris

 

?

jezero (Antarktida)

Spring et al. 2003

53:1027

Clostridium lacusfryxellense

 

?

jezero (Antarktida)

Spring et al. 2003

53:1027

Clostridium psychrophilum

 

?

jezero (Antarktida)

Spring et al. 2003

53:1028

Corynebacterium aquilae

 

?

orel

Fernández-Garayzábal et al. 2003

53:1138

Corynebacterium atypicum

 

?

humánní klinický materiál

Hall et al. 2003

53:1067

Corynebacterium sphenisci

 

?

tučňáci

Goyache et al. 2003

53:1012

Corynebacterium suicordis

 

?

prase, respirační onemocnění

Vela et al. 2003

53:2030

Croceibacter atlanticus

 

?

mořská voda

Cho and Giovannoni 2003

53:935

Crocinitomix catalasitica

 

?

ježovka; litorál, zmrzlý písek (Aljaška)

Bowman et al. 2003

53:1353

Cryomorpha ignava

 

?

mořská voda, křemen

Bowman et al. 2003

53:1353

Deferribacter abyssi

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Miroshnichenko et al. 2003

53:1640

Delftia tsuruhatensis

 

?

zpracování odpadní vody

Shigematsu et al. 2003

53:1482

Desulfomicrobium macestii

<- Desulfobacterium macestii

1

 

(Gogotova and Vainstein 1989) Hippe et al. 2003

53:1129

Desulfonatronum thiodismutans

 

?

sodné jezero

Pikuta et al. 2003

53:1331

Desulfonauticus submarinus

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Audiffrin et al. 2003

53:1589

Desulfosporosinus auripigmenti

<- Desulfotomaculum auripigmentum

1

 

(Newman et al. 1997) Stackebrandt et al. 2003

53:1442

Desulfotomaculum solfataricum

 

?

kal, solfatarové pole (Island)

Goorissen et al. 2003

53:1228

Devosia neptuniae

 

?

luštěnina (Indie)

Rivas et al. 2003

53:935

Dialister invisus

 

?

humánní klinický materiál

Downes et al. 2003

53:1940

Diaphorobacter nitroreducens

 

?

aktivovaný kal

Khan and Hiraishi 2002

53:936

Enhygromyxa salina

 

?

mořské pobřeží

Iizuka et al. 2003

53:1219

Ensifer arboris

<- Sinorhizobium arboris

1

 

(Nick et al. 1999) Young 2003

53:2109

Ensifer fredii

<- Sinorhizobium fredii

1

 

(Scholla and Elkan 1984) Young 2003

53:2109

Ensifer kostiensis

<- Sinorhizobium kostiense

1

 

(Nick et al. 1999) Young 2003

53:2109

Ensifer kummerowiae

<- Sinorhizobium kummerowiae

?

 

(Wei et al. 2002) Young 2003

53:2109

Ensifer medicae

<- Sinorhizobium medicae

1

 

(Rome et al. 1996) Young 2003

53:2109

Ensifer meliloti

<- Sinorhizobium meliloti

1

 

(Dangeard 1926) Young 2003

53:2109

Ensifer saheli

<- Sinorhizobium saheli

1

 

(De Lajudie et al. 1994) Young 2003

53:2109

Ensifer terangae

<- Sinorhizobium terangae

1

 

(De Lajudie et al. 1994) Young 2003

53:2109

Ensifer xinjiangensis

<- Sinorhizobium xinjiangense

1

 

(Chen et al. 1988) Young 2003

53:2109

Enterococcus canis

 

?

pes

De Graef et al. 2003

53:1073

Erythrobacter flavus

 

?

mořská voda

Yoon et al. 2003

53:1173

Eubacterium pyruvativorans

 

?

ovce (bachor)

Wallace et al. 2003

53:969

Flavobacterium gelidilacus

 

?

jezero (Antarktida)

Van Trappen et al. 2003

53:1244

Fulvimarina pelagi

 

?

mořská voda

Cho and Giovannoni 2003

53:1858

Garciella nitratireducens

 

?

ropný vrt

Miranda-Tello et al. 2003

53:1513

Gemmatimonas aurantiaca

 

?

bioreaktor na zpracování odpadních vod

Zhang et al. 2003

53:1161

Gordonia paraffinivorans

 

?

ropný vrt

Xue et al. 2003

53:1645

Gordonia sihwensis

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Kim et al. 2003

53:1432

Gordonia sinesedis

 

?

půda

Maldonado et al. 2003

53:1219

Grimontia hollisae

<- Vibrio hollisae

2

 

(Hickman et al. 1982) Thompson et al. 2003

53:1617

Halobacillus karajensis

 

?

slaná půda

Amoozegar et al. 2003

53:1062

Halosimplex carlsbadense

 

?

krystaly soli 250 mil. let

Vreeland et al. 2003

53:936

Herbaspirillum lusitanum

 

?

kořenové hlízy, luštěniny

Valverde et al. 2003

53:1982

Histophilus somni

 

?

hovězí dobytek, ovce

Angen et al. 2003

53:1455

Chlorobaculum tepidum

<- Chlorobium tepidum

1

 

(Wahlund et al. 1996) Imhoff 2003

53:950

Idiomarina loihiensis

 

?

podmořská sopka

Donachie et al. 2003

53:1878

Kerstersia gyiorum

 

?

humánní klinický materiál

Coenye et al. 2003

53:1830

Kitasatospora kifunensis

<- Streptomyces kifunensis

1

 

(Nakagaito et al. 1993) Groth et al. 2003

53:2038

Kitasatospora putterlickiae

 

?

rostliny, rhizosféra

Groth et al. 2003

53:2037

Kribbella koreensis

<- Hongia koreensis

1

 

(Lee et al. 2000) Sohn et al. 2003

53:1007

Lactobacillus kitasatonis

 

?

kuře (střevo)

Mukai et al. 2003

53:2058

Leifsonia aurea

 

?

porost cyanobakterií, vodní nádrž (Antarktida)

Reddy et al. 2003

53:983

Leifsonia rubra

 

?

porost cyanobakterií, vodní nádrž (Antarktida)

Reddy et al. 2003

53:982

Leuconostoc inhae

 

?

fermentovaná potravina

Kim et al. 2003

53:1126

Longispora albida

 

?

půda

Matsumoto et al. 2003

53:1558

Luteococcus sanguinis

 

?

humánní klinický materiál, krev

Collins et al. 2003

53:1891

Macrococcus brunensis

 

?

kůže lamy

Mannerová et al. 2003

53:1653

Macrococcus hajekii

 

?

kůže lamy

Mannerová et al. 2003

53:1653

Macrococcus lamae

 

?

kůže lamy

Mannerová et al. 2003

53:1653

Marinobacter excellens

 

?

mořský sediment

Gorshkova et al. 2003

53:2077

Marinobacter lipolyticus

 

?

slaná půda

Martín et al. 2003

53:1386

Marinobacter lutaoensis

 

?

mořské pobřeží, horký pramen

Shieh et al. 2003

53:1701

Mesonia algae

 

?

mořská zelená řasa

Nedashkovskaya et al. 2003

53:1970

Metallosphaera hakonensis

<- Sulfolobus hakonensis

1

 

(Takayanagi et al. 1996) Kurosawa et al. 2003

53:1608

Methanocaldococcus indicus

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

L'Haridon et al. 2003

53:1934

Methanoculleus submarinus

 

?

hlubokomořský sediment

Mikucki et al. 2003

53:1701

Methanogenium marinum

 

?

mořské sedimenty (Aljaška)

Chong et al. 2003

53:1701

Methylocella silvestris

 

?

kyselá lesní půda

Dunfield et al. 2003

53:1238

Microbacterium paraoxydans

 

?

humánní klinický materiál, bakterémie

Laffineur et al. 2003

53:936

Microbulbifer elongatus

<- Pseudomonas elongata

1

 

(Humm 1946) Yoon et al. 2003

53:1360

Muricoccus roseus

 

?

stavební materiál z dětské ložnice

Kämpfer et al. 2003

53:936

Mycobacterium caprae

<- Mycobacterium tuberculosis                subsp. caprae

3

 

(Aranaz et al. 1999) Aranaz et al. 2003

53:1788

Mycobacterium montefiorense

 

?

muréna

Levi et al. 2003

53:1701

Mycobacterium pinnipedii

 

?

tuleň

Cousins et al. 2003

53:1312

Nocardia caishijiensis

 

?

půda

Zhang et al. 2003

53:1003

Nocardia puris

 

?

humánní klinický materiál

Yassin et al. 2003

53:1598

Oceanicaulis alexandrii

 

?

mořská řasa (obrněnka)

Strömpl et al. 2003

53:1905

Oceanisphaera litoralis

 

?

pobřežní písek

Romanenko et al. 2003

53:1888

Paenibacillus agarexedens

<- "Bacillus agar-exedens"

?

půda, tlející rostlinný materiál

(ex Wieringa 1941) Uetanabaro et al. 2003

53:1056

Paenibacillus agaridevorans

 

?

půda, tlející rostlinný materiál

Uetanabaro et al. 2003

53:1056

Paenibacillus stellifer

 

?

lepenka - obalový materiál pro potraviny

Suominen et al. 2003

53:1373

Paracoccus yeei

 

?

humánní klinický materiál

Daneshvar et al. 2003

53:936

Parvularcula bermudensis

 

?

mořská voda

Cho and Giovannoni 2003

53:1035

Pedobacter cryoconitis

 

?

povrch alpského ledovce

Margesin et al. 2003

53:1295

Planococcus maritimus

 

?

mořská voda, přílivové pásmo

Yoon et al. 2003

53:2016

Planococcus rifietoensis

 

?

sirnatý pramen, řasový porost

Romano et al. 2003

53:1701

Prauserella alba

 

?

slaná půda

Li et al. 2003

53:1548

Prauserella halophila

 

?

slaná půda

Li et al. 2003

53:1548

Promicromonospora aerolata

 

?

vzduch (kaple)

Busse et al. 2003

53:1506

Promicromonospora vindobonensis

 

?

vzduch (kaple)

Busse et al. 2003

53:1505

Propionicimonas paludicola

 

?

rostlinné zbytky, zaplavené rýžové pole

Akasaka et al. 2003

53:1996

Pseudoalteromonas mariniglutinosa

<- Pseudomonas marinoglutinosa

?

mořská řasa

(ex Berland et al. 1969) Romanenko et al. 2003

53:1108

Pseudoalteromonas sagamiensis

 

?

pobřežní mořská voda

Kobayashi et al. 2003

53:1810

Pseudomonas congelans

 

?

tráva

Behrendt et al. 2003

53:1467

Pseudomonas poae

 

?

tráva

Behrendt et al. 2003

53:1467

Pseudomonas rhizosphaerae

 

?

trávy, rhizosféra

Peix et al. 2003

53:2070

Pseudomonas trivialis

 

?

tráva

Behrendt et al. 2003

53:1467

Pseudorhodobacter ferrugineus

<- Agrobacterium ferrugineum

1

 

(Rüger and Höfle 1992) Uchino et al. 2003

53:936

Psychrobacter fozii

 

?

mořské pobřeží, Antarktida

Bozal et al. 2003

53:1099

Psychrobacter luti

 

?

mořské pobřeží, Antarktida

Bozal et al. 2003

53:1098

Psychrobacter okhotskensis

 

?

mořské pobřeží

Yumoto et al. 2003

53:1988

Ralstonia insidiosa

 

?

humánní klinický materiál, prostředí

Coenye et al. 2003

53:1079

Rheinheimera pacifica

 

?

hlubokomořská voda

Romanenko et al. 2003

53:1976

Rhizobium loessense

 

?

kořenové hlízy, luštěniny

Wei et al. 2003

53:1582

Rhodocista pekingensis

 

?

čistírna odpadních vod

Zhang et al. 2003

53:1114

Rhodococcus tukisamuensis

 

?

půda

Matsuyama et al. 2003

53:1335

Rhodoglobus vestalii

 

?

vodní nádrž (Antarktida)

Sheridan et al. 2003

53:992

Roseomonas gilardii subsp. rosea

 

?

humánní klinický materiál (krev)

Han et al. 2003

53:1701

Roseomonas mucosa

 

?

humánní klinický materiál (krev)

Han et al. 2003

53:1701

Roseospira marina

 

?

pobřežní sedimenty, slané sirnaté prameny

Guyoneaud et al. 2003

53:1701

Roseospira navarrensis

 

?

pobřežní sedimenty, slané sirnaté prameny

Guyoneaud et al. 2003

53:1701

Roseospira thiosulfatophila

 

?

pobřežní sedimenty, slané sirnaté prameny

Guyoneaud et al. 2003

53:1701

Roseovarius nubinhibens

 

?

mořská voda

González et al. 2003

53:1268

Saccharomonospora paurometabolica

 

?

půda

Li et al. 2003

53:1593

Salinibacterium amurskyense

 

?

mořská voda

Han et al. 2003

53:2065

Salinisphaera shabanensis

 

?

slaná voda (Rudé moře)

Antunes et al. 2003

53:1219

Shewanella waksmanii

 

?

mořští červi

Ivanova et al. 2003

53:1476

Schlegelella thermodepolymerans

 

?

aktivovaný kal

Elbanna et al. 2003

53:1167

Silicibacter pomeroyi

 

?

mořská voda

González et al. 2003

53:1268

Soehngenia saccharolytica

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Parshina et al. 2003

53:1797

Sphingobium amiense

 

?

voda-říční sediment

Ushiba et al. 2003

53:2048

Sphingomonas aerolata

 

?

vzduch, půda, led

Busse et al. 2003

53:1259

Sphingomonas aurantiaca

 

?

zvířený prach, chov hovězího dobytka

Busse et al. 2003

53:1259

Sphingomonas faeni

 

?

zvířený prach, chov hovězího dobytka

Busse et al. 2003

53:1259

Sporomusa aerivorans

 

?

termiti

Boga et al. 2003

53:1403

Sporosarcina macmurdoensis

 

?

porost cyanobakterií (Antarktida)

Reddy et al. 2003

53:1366

Sporotomaculum syntrophicum

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Qiu et al. 2003

53:936

Staphylococcus equorum subsp. linens

 

?

složka startovací kultury pro přípravu sýru

Place et al. 2003

53:1219

Staphylococcus nepalensis

 

?

koza

Spergser et al. 2003

53:2010

Sterolibacterium denitrificans

 

?

bioreaktor na zpracování odpadu

Tarlera and Denner 2003

53:1090

Streptacidiphilus albus

 

?

kyselá půda, stelivo

Kim et al. 2003

53:1219

Streptacidiphilus carbonis

 

?

kyselá půda, stelivo

Kim et al. 2003

53:1219

Streptacidiphilus neutrinimicus

 

?

kyselá půda, stelivo

Kim et al. 2003

53:1219

Streptococcus oligofermentans

 

?

humánní klinický materiál (dentální plaky, sliny)

Tong et al. 2003

53:1103

Streptomonospora alba

 

?

slaná půda

Li et al. 2003

53:1424

Streptomyces aureus

 

?

půda

Manfio et al. 2003

53:1219

Streptomyces laceyi

 

?

půda

Manfio et al. 2003

53:1219

Streptomyces luridiscabiei

 

?

brambory, infekce

Park et al. 2003

53:2053

Streptomyces luteireticuli

<- Streptoverticillium luteoreticuli

?

 

(ex Katoh and Arai 1957) Hatano et al. 2003

53:1528

Streptomyces niveiciscabiei

 

?

brambory, infekce

Park et al. 2003

53:2053

Streptomyces puniciscabiei

 

?

brambory, infekce

Park et al. 2003

53:2053

Streptomyces sanglieri

 

?

půda

Manfio et al. 2003

53:1219

Streptomyces yatensis

 

?

zásaditá půda

Saintpierre et al. 2003

53:1219

Sulfurimonas autotrophica

 

?

hlubokomořské hydrotermální sedimenty

Inagaki et al. 2003

53:1805

Teichococcus ludipueritiae

 

?

stavební materiál z dětské ložnice

Kämpfer et al. 2003

53:936

Tepidibacter thalassicus

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Slobodkin et al. 2003

53:1133

Tepidimonas aquatica

 

?

nádrž na horkou vodu

Freitas et al. 2003

53:1701

Tepidiphilus margaritifer

 

?

bioreaktor, zpracování odpadní vody

Manaia et al. 2003

53:1409

Thermomonas brevis

 

?

biorektor (denitrifikace pitné vody)

Mergaert et al. 2003

53:1966

Thermomonas fusca

 

?

biorektor (denitrifikace pitné vody)

Mergaert et al. 2003

53:1965

Thermomonas hydrothermalis

 

?

horký pramen

Alves et al. 2003

53:936

Thialkalivibrio nitratireducens

 

?

sodné jezero

Sorokin et al. 2003

53:1783

Tindallia californiensis

 

?

sedimenty, jezero Mono Lake

Pikuta et al. 2003

53:1701

Tistrella mobilis

 

?

odpadní voda

Shi et al. 2003

53:936

Tsukamurella spumae

 

?

aktivované kaly

Nam et al. 2003

53:1701

Vibrio fortis

 

?

mořské prostředí, vodní živočichové

Thompson et al. 2003

53:1499

Vibrio hepatarius

 

?

garnát

Thompson et al. 2003

53:1500

Vibrio pacinii

 

?

garnát, mořské ryby chované v sádkách

Gomez-Gil et al. 2003

53:1572

Vibrio superstes

 

?

mořští plži (ušeň)

Hayashi et al. 2003

53:1816

Vibrio tasmaniensis

 

?

losos

Thompson et al. 2003

53:1701

Vitellibacter vladivostokensis

 

?

sumýš

Nedashkovskaya et al. 2003

53:1285

Vulcanithermus mediatlanticus

 

?

hlubokomořský hydrotermální průduch

Miroshnichenko et al. 2003

53:1147

Wautersia respiraculi

<- Ralstonia respiraculi

?

 

(Coenye et al. 2003) Vaneechoutte et al. 2004

54:325

Zooshikella ganghwensis

 

?

sediment

Yi et al. 2003

53:1016

 

Charakteristika rizikových skupin 1 až 3 dle patogenity mikroorganismů

1 Mikroorganismy, u nichž je malá pravděpodobnost, že vyvolají onemocnění lidí nebo zvířat.

2 Mikroorganismy, které mohou být příčinou onemocnění lidí a/nebo zvířat. Existuje proti nim obvykle účinná profylaxe a způsobená onemocnění jsou léčitelná.

3 Mikroorganismy, které vyvolávají vážná onemocnění lidí a/nebo zvířat. Existuje proti nim účinná profylaxe a způsobená onemocnění jsou léčitelná.

?  Údaje o patogenitě nejsou známy.