Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2006; 15(5): 196 – 198.

 

Dominantní činnost Národních referenčních laboratoří v roce 2005 v oboru mikrobiologie mimo SZÚ – CEM

Major activities of National Reference Labortaories in microbiology outside NIPH-CEM

  

Desetiřádková sdělení vypracovali vedoucí jednotlivých NRL, jako součást zpráv o činnosti za rok 2005.

 

NRL pro diagnostiku střevních parazitóz

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Příprava vzorků a hodnocení výsledků EHK - mikroskopická diagnostika střevních parazitů.

Metodické vedení diagnostických pracovišť.

 

 

 

 

Shromažďování a vyhodnocování údajů z jednotlivých pracovišť o počtech. provedených  vyšetření a výskytu střevních parazitů v ČR.

Epidemiologické sledování výskytu Entamoeba hystolytica/dispar v ČR.

 

NRL pro diagnostiku syfilis

 

provádí konfirmační vyšetření na syfilis pacientů z celé ČR, vede registr nemocných syfilis, udržuje referenční kmen Nichols Treponema pallidum susp. pallidum. Poskytuje konzultace a školení, ve spolupráci s IPVZ i individuálně, pro lékaře, JVŠ a SZP v diagnostice syfilis. Ve spolupráci se SZÚ připravuje  a vyhodnocuje  kontrolní vzorky séra určené k EHK diagnostiky syfilis pro cca 170 terénních laboratoří. Spolupracuje na grantovém úkolu IGA MZ ČR – séologická diagnostika a epidemiologie syfilis a mezinárodním projektu ESO – preventivní a léčebné péče pro rizikové skupiny pacientů (z oblasti komerčního sexu). Podílí se na práci odborných společností JEP a Rady registru PN.

 

NRL pro pertusi a parapertusi

 

Vyšetřování klinického materiálu od pacientů se syndromem dávivého kašle (kultivační a sérologické).

Ověřování výsledků sérologických vyšetření na přání jiných laboratoří.

Ověřování a typizace kmenů B. pertussis izolovaných a zaslaných  mikrobiologickými laboratořemi z terénu.

Metodické konzultace, přednášky, semináře.

NRL pro patogenní aktinomycety

 

V 23.9.2004 obnovena smlouva s MZČR. Pokračuje relyofilizace CCTR s fotografickou dokumentací a s fenotypovou identifikací kmenů. CCTR obsahuje 1100 kmenů rodů Nocardia, Actinomyces, Rhodococcus, Corynebacterium a dalších baktérií. Únor 2005 spolupráce s prof. Dagem Harmsenem z Univerzity v Münsteru v Německu  na molekulárně genetické identifikaci baktérií  sekvenací 16SrRNA genu. Mezinárodní studie cca 60 sbírkových kmenů nokardií – NRL pro patogenní aktinomycety Trutnov (fenotypová identifikace), Univerzita Münster (sekvenace 16SrRNA a rpoB sekvenace),  Oddělení bakteriologie a mb technologie Centra mikrobiologie, parazitologie a imunologie ZÚ Ostrava (Analýza mastných kyselin pomocí SHERLOCK MIDI,) a NRL pro antibiotika, SZÚ Praha (stanovení MIC). Spolupráce s pracovišti klinické mikrobiologie. Spolupráce s IPVZ.

 

NRL pro imunologii

 

Hlavní činností byla příprava, zajištění kontrolních vzorků pro externí kontrolu kvality práce v imunologických laboratořích a vyhodnocení kontrolních cyklů SEKK a SZÚ. Byly připraveny materiální podmínky pro zavedení nového kontrolního cyklu, zaměřeného na diagnostiku orgánových autoimunitních procesů. Byla vypracována metoda fixace leukocytů pro potřebu imunofenotypové analýzy.

Rozsah činnosti je srovnatelný s předchozími roky.

 

NRL pro lékařskou mykologii

 

Činnost NRL byla zaměřena na problematiku lipofilních kvasinek,  které už nejsou jen komensály kůže, ale vyvolávají celkové fatální onemocnění hlavně u kojenců a malých dětí, dále na kryptokokózu, která dnes patří k prvým diagnostickým kritériím AIDS, na stoupající problém alergické alveolitidy a farmářské plíce a syndrom podobný farmářské plíci. K řadě sérologických reakcí, které  používáme u těchto nemocí, jsme stanovili další. Protože mykózy se stávají stále větším problémem diagnostickým, zaměřili jsme se také na možnost prevence a terapie vakcinami.

 

NRL pro diagnostiku cytomegalovirů

 

NRL otestovala pro CMV 6 komerčních souprav pro průkaz IgG a IgM protilátek proti CMV a jednu soupravu pro stanovení avidity IgG. RL pokračovala ve sběru kmenů CMV izolovaných od imunosuprimovaných pacientů i kmenů kontrolních od imunokompetentních pacientů pro průkaz rezistence na ganciclovir molekulárně biologickými metodami (celkem 26 kmenů). RL spolupracuje s laboratoří pro průkaz extrahumánního genomu ÚKBD a ÚKM FN Hradec Králové při sledování pacientů s CMV infekcí léčených ganciclovirem (kvantifikace CMV DNA). NRL připravila vzorky sér pro detekci IgG a IgM protilátek proti CMV pro EHK 2005.

NRL pro biomarkery mykotoxinů a mykotoxiny  v potravinách

 

Počty vzorků se týkají, jak stanovení ochratoxinu A v lidských sérech, tak stanovení mykotoxinů (aflatoxinů B1, B2, G1, G2, M1, ochratoxinu A, patulinu, deoxynivalenolu, zearalenonu a fumonisinů B1, B2) v potravinách (pozn.: v tabulce zahrnuty do skupiny výrobků) metodami akreditovanými u ČIA.

NRL spolupracuje v oblasti mykotoxinů s Laboratory of Genetics Chemistry, Dept. of Bioprocesses and Microbiological Systems, ENSAT ( Institut of Agriculture for Agronomy), Avenue agrobiopole, 31 326 Auzeville-Tolosane, FRANCE (Head: Mrs. Prof.A.Leszkowicz, DSc).

 

NRL pro anaerobní bakterie

 

Zpráva o dominantní činnosti NRL nebyla dodána

 

 

NRL Mycobacterium kansasii

 

V roce 2005 pokračovala spolupráce NRL pro M.kansasii s Farmaceutickou fakultou Univerzity Karlovy v Hradci Králové na vývoji nových antimykobakteriálních látek. Byla testována citlivost vybraných mykobakteriálních druhů in vitro na preparáty připravené na FF.

Vedoucí NRL spolupracovala se SZÚ a MZ ČR na přípravě novelizace vyhlášky č.252/2004 Sb., kterou se stanoví hygienické požadavky na pitnou a teplou vodu zpracováním metodických pokynů pro odběry vzorků a metodik pro jejich zpracování. Pro žadatele z MSk vyšetřila NRL 90 vzorků teplé vody a druhově identifikovala mykobakteriální kmeny, které z nich byly izolovány. Vedoucí NRL-Mk se aktivně zúčastnila konference pořádané European Society of Mycobacteriology v Istanbulu v Turecku, kde prezentovala kazuistiku miliární tuberkulózy diagnostikované MB BacT ® hemokulturou.

   

NRL pro arboviry

 

NRL prováděla specializovaná vyšetření podle požadavků zařízení léčebně preventivní péče, virologických, parazitologických a epidemiologických pracovišť v rámci HS i nemocnic: diagnostika protilátek proti viru klíšťové encefalitidy metodou KFR, VNT, ELISA Ig a IgM, dále diagnostika protilátek anti-Dengue viru metodami ELISA IgG a IgM, diagnostika protilátek anti-West Nile viru metodou VNT, ELISA IgG a IgM a diagnostika protilátek proti viru žluté zimnice metodou VNT. Byly provedeny izolační pokusy z klíšťat na záchyt arbovirů. Izolováno bylo 5 kmenů viru  klíšťové encefalitidy: 4 kmeny z Prahy 4 – Kunratický les a 1 kmen z Prahy 6 – Divoká Šárka. Byla objasněna alimentární epidemie klíšťové encefalitidy na Opavsku po požití kozího mléka průkazem specifických protilátek u postižených osob a u příslušných zvířat metodami ELISA a VNT. NRL udržovala referenční kmeny a séra a na vyžádání je poskytovala. Byla připravena séra pro kruhové vzorky určené k testování sérologické diagnostiky klíšťové encefalitidy v rámci EHK a vyhodnoceny výsledky zúčastněných laboratoří v sérii EHK-439.

 

NRL pro urogenitální trichomonózu

 

NRL každoročně připravuje a vyhodnocuje okružní vzorky EHK ve dvou kolech vždy pro 80 laboratoří.

Prověřuje kvalitu půd připravovaných v jednotlivých diagnostických laboratořích, které si o kontrolu růstových podmínek půd pro trichomonády požádají. Účastníkům EHK poskytuje písemná doporučení a kontrolní vzorky ke zkvalitnění přípravy diagnostických médií a postupů.       

 Aktivními vystoupeními se vedoucí NRL podílel na odborném programu semináře České parazitologické společnosti ve Velkých Karlovicích.  Ve časopise Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2005; 14(4): s. 196 – 199 publikoval zkušenosti získané z deseti kol externího hodnocení kvality.

Pro výrobce půd Imuna Pharm, a.s., Šarišské Michaľany, SR, testuje NRL kvalitu vyrobených šarží.

Laboratoř ověřovala záchytnost a možnost dlouhodobé kultivace trichomonád v půdách dostupných v ČR.

Věnovala se axenizaci kultur. Experimentálně sledovala podmínky pro vznik morfologicky rozdílných forem při akutních a chronických infekcích.

 

NL pro tetanus

 

Zpráva o dominantní činnosti  nebyla dodána

 

NRL pro legionely

 

NRL pro legionely vyšetřila 1650 vzorků vod různého původu. Dále 539 vzorků klinických a identifikovala 58 kmenů legionel. Do systému EWGLINET nahlásila 12 prokázaných nákaz
(1 úmrtí, 2 izoláty Legionella pneumophila a jeden L.micdadei).

Vedoucí NRL se zúčastnil zasedání EWGLINET v Římě a Berlíně. Přednášel na Kongresu o bazénech v Budapešti a na velkém Kongresu o legionelách v Chicagu. Příspěvky byly přijaty k publikaci. Vedoucí NRL dále vyučoval na EC Kurzu prevence legionelóz v Londýně. Pro WHO v Ženevě se podílel na sepsání kapitoly o problematice bazénů pro Guidelines for Legionella, které právě vycházejí.

 

NRL pro antrax

 

V souladu s požadavky veterinárně hygienického dozoru bylo vyšetřeno 45 vzorků

a to 41 vzorků klihovek a 4 vzorky hovězích žíní. Jednalo se o dovoz ze Slovenska, Německa, Rakouska, Španělska, Holandska, Italie a Švédska. Bacillus anthracis nebyl ve vyšetřovaných vzorcích prokázán .

 

NRL pro vzteklinu

 

Činnost  NRL  byla zaměřena vedle diagnostiky vztekliny na přípravu a laboratorní kontrolu orální antirabické vakcinace lišek v ČR. Dále byla zajišťována mezinárodní výměna informací o nákazové situaci s referenčními centry sousedních zemí. NRL prováděla stanovení antirabických protilátek u domácích masožravců, absolvovala úspěšně další mezinárodní proficiency test a obnovila tak autorizaci NRL pro tuto činnost v rámci EU.

NRL byla pověřena spoluprací s WHO Collaborating Centre for Rabies Surveillance and Research, Fed. Res. Ctentre for Virus Dis., Seestr. 55,  D – 16868 WUSTERHAUSEN, Germany  na přípravě čtvrtletních hlášení pro Rabies Bulletin Europe.

 

NRL pro tkáňové helmintozy

 

Zpráva o dominantní činnosti nebyla dodána

 

NRL pro dg. oportunních parazitárních nákaz

 

Zpráva o činnosti nebyla dodána

 

NRL pro diagnostiku tropických parazitárních infekcí

 

Kromě běžné referenční a konzultační činnosti, stáží a kurzů, laboratoř i v roce 2005 připravila pro AP CEM vzorky EHK v rámci okruhu "Mikroskopická diagnostika tropických tkáňových parazitóz", kterého se aktivně zúčastnilo 24 laboratoří.

 

NRL pro papillomaviry

 

NRL provedla 832 vyšetření HPV v rozličných materiálech pomocí několika komerčních setů i „in house“ technik.  Na pracovišti řešíme jeden projekt financovaný českou grantovou agenturou.  Výsledky ukončeného grantového projektu zabývajícího se vztahem HPV k prekancerózám a karcinomu vulvy a anu jsme prezentovali na 22. mezinárodní papillomavirové konferenci ve Vancouveru.  V letošním roce jsme přednášeli ve 3 kurzech IPVZ.  Jeden student úspěšně obhájil diplomovou práci a jedna doktorandka disertační práci.  Laboratoř uspořádala odbornou konferenci, kde bylo předneseno 11 příspěvků a účastnilo se 120 lidí.  Pracovníci laboratoře přednášeli dále na 4 konferencích.  Rozeslali jsme další sérii EHK.  Získali jsme certifikát z mezinárodního EHK.  Tři pracovníci se stali členy komise pro vakcinaci proti papillomavirův při MZ ČR.  NRL se stala reprezentantem ÚHKT v mezinárodní organizaci European Cervical Cancer Association.  NRL vytvořila nové webové stránky.

 

Připravili:

 

RNDr. V. Rupeš, CSc.

CEM-SZÚ

 

Ing. M. Juskanin

Oddělení biostatistiky a informatiky, SZÚ