Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2006; 15(5): 196 – 198.
Dominantní činnost
Národních referenčních laboratoří v roce 2005 v oboru mikrobiologie mimo
SZÚ – CEM
Major
activities of National Reference Labortaories in microbiology outside NIPH-CEM
Desetiřádková sdělení vypracovali vedoucí jednotlivých
NRL, jako součást zpráv o činnosti za rok 2005.
NRL pro diagnostiku střevních parazitóz |
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Příprava vzorků a hodnocení výsledků EHK - mikroskopická diagnostika střevních parazitů. |
||||||||
Metodické vedení diagnostických pracovišť. |
|
|
|
|
||||
Shromažďování a vyhodnocování údajů z jednotlivých pracovišť o počtech. provedených vyšetření a výskytu střevních parazitů v ČR. Epidemiologické sledování výskytu Entamoeba hystolytica/dispar v ČR. NRL pro diagnostiku syfilis provádí konfirmační vyšetření na syfilis pacientů z celé ČR, vede registr nemocných syfilis, udržuje referenční kmen Nichols Treponema pallidum susp. pallidum. Poskytuje konzultace a školení, ve spolupráci s IPVZ i individuálně, pro lékaře, JVŠ a SZP v diagnostice syfilis. Ve spolupráci se SZÚ připravuje a vyhodnocuje kontrolní vzorky séra určené k EHK diagnostiky syfilis pro cca 170 terénních laboratoří. Spolupracuje na grantovém úkolu IGA MZ ČR – séologická diagnostika a epidemiologie syfilis a mezinárodním projektu ESO – preventivní a léčebné péče pro rizikové skupiny pacientů (z oblasti komerčního sexu). Podílí se na práci odborných společností JEP a Rady registru PN. |
NRL pro pertusi a parapertusi
Vyšetřování klinického materiálu od pacientů se syndromem dávivého kašle (kultivační a sérologické).
Ověřování výsledků sérologických vyšetření na přání jiných laboratoří.
Ověřování a typizace kmenů B. pertussis izolovaných a zaslaných mikrobiologickými laboratořemi z terénu.
Metodické konzultace, přednášky, semináře.
V 23.9.2004 obnovena smlouva s MZČR. Pokračuje relyofilizace CCTR s fotografickou dokumentací a s fenotypovou identifikací kmenů. CCTR obsahuje 1100 kmenů rodů Nocardia, Actinomyces, Rhodococcus, Corynebacterium a dalších baktérií. Únor 2005 spolupráce s prof. Dagem Harmsenem z Univerzity v Münsteru v Německu na molekulárně genetické identifikaci baktérií sekvenací 16SrRNA genu. Mezinárodní studie cca 60 sbírkových kmenů nokardií – NRL pro patogenní aktinomycety Trutnov (fenotypová identifikace), Univerzita Münster (sekvenace 16SrRNA a rpoB sekvenace), Oddělení bakteriologie a mb technologie Centra mikrobiologie, parazitologie a imunologie ZÚ Ostrava (Analýza mastných kyselin pomocí SHERLOCK MIDI,) a NRL pro antibiotika, SZÚ Praha (stanovení MIC). Spolupráce s pracovišti klinické mikrobiologie. Spolupráce s IPVZ.
NRL pro
imunologii
Hlavní činností byla příprava, zajištění kontrolních vzorků pro externí kontrolu kvality práce v imunologických laboratořích a vyhodnocení kontrolních cyklů SEKK a SZÚ. Byly připraveny materiální podmínky pro zavedení nového kontrolního cyklu, zaměřeného na diagnostiku orgánových autoimunitních procesů. Byla vypracována metoda fixace leukocytů pro potřebu imunofenotypové analýzy.
Rozsah činnosti je srovnatelný s předchozími roky.
NRL pro lékařskou mykologii
Činnost NRL byla zaměřena na problematiku lipofilních kvasinek, které už nejsou jen komensály kůže, ale vyvolávají celkové fatální onemocnění hlavně u kojenců a malých dětí, dále na kryptokokózu, která dnes patří k prvým diagnostickým kritériím AIDS, na stoupající problém alergické alveolitidy a farmářské plíce a syndrom podobný farmářské plíci. K řadě sérologických reakcí, které používáme u těchto nemocí, jsme stanovili další. Protože mykózy se stávají stále větším problémem diagnostickým, zaměřili jsme se také na možnost prevence a terapie vakcinami.
NRL pro diagnostiku cytomegalovirů
NRL otestovala pro CMV 6 komerčních souprav pro průkaz IgG a
IgM protilátek proti CMV a jednu soupravu pro stanovení avidity IgG. RL
pokračovala ve sběru kmenů CMV izolovaných od imunosuprimovaných pacientů i
kmenů kontrolních od imunokompetentních pacientů pro průkaz rezistence na
ganciclovir molekulárně biologickými metodami (celkem 26 kmenů). RL
spolupracuje s laboratoří pro průkaz extrahumánního genomu ÚKBD a ÚKM FN Hradec
Králové při sledování pacientů s CMV infekcí léčených ganciclovirem
(kvantifikace CMV DNA). NRL připravila vzorky sér pro detekci IgG a IgM
protilátek proti CMV pro EHK 2005.
NRL pro biomarkery mykotoxinů a mykotoxiny v potravinách
Počty vzorků se týkají, jak stanovení ochratoxinu A v lidských sérech, tak stanovení mykotoxinů (aflatoxinů B1, B2, G1, G2, M1, ochratoxinu A, patulinu, deoxynivalenolu, zearalenonu a fumonisinů B1, B2) v potravinách (pozn.: v tabulce zahrnuty do skupiny výrobků) metodami akreditovanými u ČIA.
NRL spolupracuje v oblasti mykotoxinů s Laboratory of Genetics Chemistry, Dept. of Bioprocesses and Microbiological Systems, ENSAT ( Institut of Agriculture for Agronomy), Avenue agrobiopole, 31 326 Auzeville-Tolosane, FRANCE (Head: Mrs. Prof.A.Leszkowicz, DSc).
NRL pro anaerobní bakterie
Zpráva o dominantní činnosti NRL nebyla dodána
NRL Mycobacterium
kansasii
V roce 2005 pokračovala spolupráce NRL pro M.kansasii s Farmaceutickou fakultou Univerzity Karlovy v Hradci Králové na vývoji nových antimykobakteriálních látek. Byla testována citlivost vybraných mykobakteriálních druhů in vitro na preparáty připravené na FF.
Vedoucí NRL spolupracovala se SZÚ a MZ ČR na přípravě novelizace vyhlášky č.252/2004 Sb., kterou se stanoví hygienické požadavky na pitnou a teplou vodu zpracováním metodických pokynů pro odběry vzorků a metodik pro jejich zpracování. Pro žadatele z MSk vyšetřila NRL 90 vzorků teplé vody a druhově identifikovala mykobakteriální kmeny, které z nich byly izolovány. Vedoucí NRL-Mk se aktivně zúčastnila konference pořádané European Society of Mycobacteriology v Istanbulu v Turecku, kde prezentovala kazuistiku miliární tuberkulózy diagnostikované MB BacT ® hemokulturou.
NRL prováděla specializovaná vyšetření podle požadavků zařízení léčebně preventivní péče, virologických, parazitologických a epidemiologických pracovišť v rámci HS i nemocnic: diagnostika protilátek proti viru klíšťové encefalitidy metodou KFR, VNT, ELISA Ig a IgM, dále diagnostika protilátek anti-Dengue viru metodami ELISA IgG a IgM, diagnostika protilátek anti-West Nile viru metodou VNT, ELISA IgG a IgM a diagnostika protilátek proti viru žluté zimnice metodou VNT. Byly provedeny izolační pokusy z klíšťat na záchyt arbovirů. Izolováno bylo 5 kmenů viru klíšťové encefalitidy: 4 kmeny z Prahy 4 – Kunratický les a 1 kmen z Prahy 6 – Divoká Šárka. Byla objasněna alimentární epidemie klíšťové encefalitidy na Opavsku po požití kozího mléka průkazem specifických protilátek u postižených osob a u příslušných zvířat metodami ELISA a VNT. NRL udržovala referenční kmeny a séra a na vyžádání je poskytovala. Byla připravena séra pro kruhové vzorky určené k testování sérologické diagnostiky klíšťové encefalitidy v rámci EHK a vyhodnoceny výsledky zúčastněných laboratoří v sérii EHK-439.
NRL každoročně připravuje a vyhodnocuje okružní vzorky EHK ve dvou kolech vždy pro 80 laboratoří.
Prověřuje kvalitu půd připravovaných v jednotlivých diagnostických laboratořích, které si o kontrolu růstových podmínek půd pro trichomonády požádají. Účastníkům EHK poskytuje písemná doporučení a kontrolní vzorky ke zkvalitnění přípravy diagnostických médií a postupů.
Aktivními vystoupeními se vedoucí NRL podílel na odborném programu semináře České parazitologické společnosti ve Velkých Karlovicích. Ve časopise Zprávy CEM (SZÚ, Praha) 2005; 14(4): s. 196 – 199 publikoval zkušenosti získané z deseti kol externího hodnocení kvality.
Pro výrobce půd Imuna Pharm, a.s., Šarišské Michaľany, SR, testuje NRL kvalitu vyrobených šarží.
Laboratoř ověřovala záchytnost a možnost dlouhodobé kultivace trichomonád v půdách dostupných v ČR.
Věnovala se axenizaci kultur. Experimentálně sledovala podmínky pro vznik morfologicky rozdílných forem při akutních a chronických infekcích.
NL pro tetanus
Zpráva o dominantní činnosti nebyla dodána
NRL pro legionely
NRL pro legionely vyšetřila 1650 vzorků vod různého původu.
Dále 539 vzorků klinických a identifikovala 58 kmenů legionel. Do systému
EWGLINET nahlásila 12 prokázaných nákaz
(1 úmrtí, 2 izoláty Legionella
pneumophila a jeden L.micdadei).
Vedoucí NRL se
zúčastnil zasedání EWGLINET v Římě a Berlíně. Přednášel na Kongresu o
bazénech v Budapešti a na velkém Kongresu o legionelách v Chicagu.
Příspěvky byly přijaty k publikaci. Vedoucí NRL dále vyučoval na EC Kurzu
prevence legionelóz v Londýně. Pro WHO v Ženevě se podílel na sepsání
kapitoly o problematice bazénů pro Guidelines for Legionella, které právě
vycházejí.
NRL pro antrax
V souladu s požadavky veterinárně hygienického dozoru bylo vyšetřeno 45 vzorků
a to 41 vzorků klihovek a 4 vzorky hovězích žíní. Jednalo se o dovoz ze Slovenska, Německa, Rakouska, Španělska, Holandska, Italie a Švédska. Bacillus anthracis nebyl ve vyšetřovaných vzorcích prokázán .
NRL pro vzteklinu
Činnost NRL byla zaměřena vedle diagnostiky vztekliny na přípravu a laboratorní kontrolu orální antirabické vakcinace lišek v ČR. Dále byla zajišťována mezinárodní výměna informací o nákazové situaci s referenčními centry sousedních zemí. NRL prováděla stanovení antirabických protilátek u domácích masožravců, absolvovala úspěšně další mezinárodní proficiency test a obnovila tak autorizaci NRL pro tuto činnost v rámci EU.
NRL byla pověřena spoluprací s WHO Collaborating Centre for Rabies Surveillance and Research, Fed. Res. Ctentre for Virus Dis., Seestr. 55, D – 16868 WUSTERHAUSEN, Germany na přípravě čtvrtletních hlášení pro Rabies Bulletin Europe.
NRL pro tkáňové helmintozy
Zpráva o dominantní činnosti nebyla dodána
NRL pro dg. oportunních parazitárních nákaz
Zpráva o činnosti nebyla dodána
NRL pro diagnostiku tropických parazitárních infekcí
Kromě běžné referenční a konzultační činnosti, stáží a kurzů, laboratoř i v roce 2005 připravila pro AP CEM vzorky EHK v rámci okruhu "Mikroskopická diagnostika tropických tkáňových parazitóz", kterého se aktivně zúčastnilo 24 laboratoří.
NRL pro papillomaviry
NRL provedla 832 vyšetření HPV v rozličných materiálech pomocí několika komerčních setů i „in house“ technik. Na pracovišti řešíme jeden projekt financovaný českou grantovou agenturou. Výsledky ukončeného grantového projektu zabývajícího se vztahem HPV k prekancerózám a karcinomu vulvy a anu jsme prezentovali na 22. mezinárodní papillomavirové konferenci ve Vancouveru. V letošním roce jsme přednášeli ve 3 kurzech IPVZ. Jeden student úspěšně obhájil diplomovou práci a jedna doktorandka disertační práci. Laboratoř uspořádala odbornou konferenci, kde bylo předneseno 11 příspěvků a účastnilo se 120 lidí. Pracovníci laboratoře přednášeli dále na 4 konferencích. Rozeslali jsme další sérii EHK. Získali jsme certifikát z mezinárodního EHK. Tři pracovníci se stali členy komise pro vakcinaci proti papillomavirův při MZ ČR. NRL se stala reprezentantem ÚHKT v mezinárodní organizaci European Cervical Cancer Association. NRL vytvořila nové webové stránky.
Připravili:
RNDr. V. Rupeš, CSc.
CEM-SZÚ
Ing. M. Juskanin
Oddělení biostatistiky
a informatiky, SZÚ