Zprávy
CEM (SZÚ, Praha) 2005; 14(12): 515.
Varianta Chlamydia trachomatis s delecí (ztrátou části DNA) na
kryptickém plasmidu: důsledky pro použití diagnostických PCR testů
![]()
A
variant of Chlamydia trachomatis with deletion in cryptic plasmid: implications
for use of PCR diagnostic tests
Vladimír Príkazský, Kateřina Fabiánová,
Kateřina Roubalová
Eurosurveillance weekly uvedla zajímavou informaci o problémech s diagnostikou Chlamydia trachomatis ve Švédsku.
Ve Švédsku byla zjištěna nová varianta Chlamydia trachomatis
s delecí (ztrátou části DNA) na kryptického plasmidu po nečekaném 25%
poklesu záchytu infekcí C.trachomatis v období od listopadu 2005
do srpna 2006 v okresu Halland na jihozápadu země. Počet vyšetřených
pacientů byl srovnatelný s počtem pacientů vyšetřených ve stejném období o rok
dříve:
Laboratoře ve Švédsku používají v posledním desetiletí pro diagnostiku C.trachomatis amplifikační testy nukleových kyselin. Tyto testy využívají kryptický plasmid jako cílové místo (tento plasmid má v C.trachomatis neznámou funkci). Pokud by nedávno pozorovaný pokles záchytu infekcí chlamydiemi nebyl způsoben skutečným poklesem počtu těchto onemocnění, mohl by být způsoben změnou cílového místa v kryptickém plasmidu nebo ztrátou celého plasmidu. Takový kmen by měl odlišné epidemiologické charakteristiky, protože by nebyl prokazatelný většinou screeningových metod a nevyhledávaly by se kontakty symptomatických indexních pacientů. Proto byla pro testování souběžně použita PCR, která prokazuje část genu pro hlavní membránový antigen (MOMP) lokalizovaný na bakteriálním chromozómu (komerční test od firmy Artus).
Okresní mikrobiologie v Halmstadu, v okresu Halland, provedla testy v 1700 vzorcích specifickou PCR reakcí na MOMP (Artus) paralelně s testem PCR plasmidu m2000 (Abbott). Ve 13% se zjistila varianta kmene C.trachomatis, u které byl pozitivní jen test na MOMP. Klinické projevy infekcí způsobených těmito kmeny nenaznačovaly odlišnost od infekcí způsobených divokým kmenem.
Zdá se, že se tyto kmeny vyskytují v celém Švédsku, vzhledem k tomu, že se prokázaly na severu, východu i jihu země. Dosud nebyl stanoven rozsah prevalence. Nálezy v celé zemi naznačují, že tento pozměněný kmen není pravděpodobně novým jevem.
Sekvenace části plasmidu variantního kmene ukázala deleci 377 párů bazí v cílovém místě plasmidu používaném testy firme Abbott a Roche. Testovalo se dalších dvanáct divokých kmenů a zjistila se stejná delece. Obě firmy byly informovány a situaci řeší. Tato delece nepostihuje místo, které využívá další test BD-ProbeTec test. V laboratoři v Halmstadu se začala vyvíjet specifická PCR reakce pro testování variantního kmene C.trachomatis.
Nález variantního kmene C.trachomatis přesto nevysvětluje 25% pokles incidence infekcí tímto patogenem, zvláště pokud tato varianta cirkuluje několik let. Po deseti letech téměř nepřetržitého vzestupu notifikovaných případů infekcí C.trachomatis (z 332 v roce 1996 na 1000 případů v roce 2005) by nebyl pokles z přirozených důvodů překvapující, ale pokles o 25% je vyšší než očekávaný. Autoři se pokoušejí zjistit, jak dlouho tento kmen cirkuluje nepoznán a zda se to projevilo i jinde. Pokud čtenáři v dalších zemích zaznamenali nevysvětlitelný pokles výskytu infekcí C.trachomatis nebo prokázali výskyt uvedeného variantního kmene, spojte se laskavě s autory prostřednictvím mailu torvald.ripa@lthalland.se.
Department of Clinical Microbiology & Infection Control Halland, Halmstad, Sweden
Ripa T,
Nilsson P. A variant of Chlamydia trachomatis with deletion in
cryptic plasmid: implications for use of PCR diagnostic tests. Euro Surveill
2006;11(11):E061109.2. Available from: http://www.eurosurveillance.org/ew/2006/061109.asp#2
Poznámka NRL pro chlamydie:
Na detekci kryptického plazmidu je založena většina komerčních PCR testů. Tento plazmid je obsažen v Chlamydia trachomatis v 7-10 kopiích a jeho záchyt je tudíž citlivější, než záchyt bakteriální chromozomální DNA. Plazmid není přítomen v ostatních druzích lidských chlamydií a není nezbytný pro bakteriální replikační cyklus. Sporadický výskyt kmenů, které kryptický plazmid ztratily, je znám již z 90. let (Peterson et al.,1990, Plasmid:23, 144). Dosud se předpokládlo, že tyto kmeny jsou velmi vzácné: PCR test od Roche byl validován na 260 vzorcích [Loeffelholz et al. J.Clin.Microbiol 1992; 30: 2847) a nezachytil ani jediný podobný kmen. Šíření kmenů s mutací nebo delecí v kryptickém plazmidu by mohlo souviset s používáním obdobných PCR testů pro screeningová vyšetření: včasné zaléčení asymptomatických infekcí, zachycených těmito testy, by mohlo vést k omezení jejich cirkulace v populaci ve prospěch minoritních kmenů, které cílové místo pro tento druh testů neobsahují. V ČR, kde screeningová šetření dosud neprobíhají, může být epidemiologická situace jiná. Přesto je ale nutno s tímto jevem počítat. Vzorky, u nichž je podezření na falešnou negativitu v PCR detekující kryptický plasmid, např. vzorky od pacientů s klinickými a sérologickými příznaky chlamydiové infekce a negativním nálezem v PCR, je možno poslat ke konfirmaci do NRL pro chlamydie.
Zpracovali: podle Eurosurveillance weekly
(http://www.eurosurveillance.org/ew/2006/061109.asp#2 )
V. Príkazský, K.
Fabiánová, K. Roubalová,
SZÚ-CEM