Probíhající:

• Molekulární surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice, hodnocení vakcinační strategie a doporučení k aktualizaci. AZV ČR, Reg. č. 17-29256A, 2017 – 2020. Hlavní řešitel: MUDr. Jana Kozáková, spolupracovníci: MUDr. Pavla Křížová CSc., Mgr. Zuzana Vacková, RNDr. Martin Musílek, Ph.D.
• SpidNET – (Streptococcus pneumonie invasive disease network): Assessing the impact and affectiveness of conjugate vaccines on the invasive pneumococcal disease in europe. 2012 – koordinátor - MUDr. P. Křížová, odborný pracovník MUDr. J. Kozáková
• ECDC – IBD-LabNET , MUDr. J. Kozáková
• Projekt  financovaný z institucionální podpory 2018. Celogenomová analýza Streptococcus pyogenes – výskyt streptokokových pyrogenních exotoxinů a superantigenů

Ukončené:

• Projekt  financovaný z institucionální podpory 2017. Molekulární charakterizace izolátů Streptococcus pneumoniae zachycených při selhání vakcinace proti pneumokokovým infekcím u dětí pod 5 let věku v České republice 2012-2014.
• Projekt  financovaný z institucionální podpory 2014. RT-PCR pro detekci Neisseria meningitidis a Streptococcus pneumoniae z klinického materiálu a bezkultivační molekulární typizace. Vacková Z, Lžičařová J, Kozáková J.
• Výzkumný záměr SZÚ/MZ ČR. Dílčí záměr II. Prevence, diagnostika a terapie závažných a nových či znovu se objevujících infekcí. Cíl č. 12. Nové přístupy k diagnostice a prevenci vybraných streptokokových nákaz (1999-2003). Koordinátor-RNDr.J.Motlová.
• Novorozenecké infekce vyvolané Streptococcus agalactiae: mikrobiologické, epidemiologické a molekulárně genetické charakteristiky. Grant MZ ČR, Reg. Č. NI/5906-3, 2000-2002. Řešitel- RNDr.J.Motlová, spoluředitel- MUDr.M.Hanzl, odborní spolupracovníci- MUDr.L.Straková, RNDr.P.Urbášková, RNDr.R.Bícová, MUDr.P.Sak.
• Analýza příčin a šíření rezistence k antibiotikům u kmenů Streptococcus pneumonie a Streptococcus pyogenes v České republice. IGA MZ ČR, Reg. Č. NI/6799-3, 2001-2003. Projekt NRL pro antibiotika, odborný spolupracovník- RNDr.J.Motlová
• Molekulárně genetická typizace Streptococcus pyogenes: emm typizace. Grant MZ ČR, Reg.č. NI/7382-3, 2003-2005. Řešitel- RNDr.J.Motlová, odborný spolupracovník- MUDr.L.Straková.
• Streptococcus pneumonie: studium genetických, mikrobiologických a epidemiologických charakteristik kmenů ve vztahu k zpřesnění diagnostiky onemocnění a vakcinaci. Grant MZ ČR, Reg. č. NR/8770-3, 2006-2008. Řešitel-RNDr.J.Motlová, odborný spolupracovník- Ing.J.Alboková.
• Molekulární determinanty kmenů Streptococcus agalactiae ve vztahu i invazivitě onemocnění. Grant MZ ČR, Reg.č. 9432-3, 2007-2009. Řešitel- MUDr. L.Straková, spoluředitelé- MUDr.M.Sádlo/MUDr.P.Srnský, odborný spolupracovník-RNDr.J.Motlová.
• Severe Streptococcus pyogenes disease in Europe. Strep-EURO, 2003-2005, koordinátor- MUDr.P.Křížová, odborní spolupracovníci- RNDr.J.Moltová, MUDr.L.Straková
• Strep-specific targeted research project - PREVIS (Pneumococcal resistence, epidemicity and virulence - an international study, 2003-2005. Projekt NRL pro antibiotika, odborný spolupracovník- RNDr. J.Motlová
• Evropský projekt EP/7 DEVANI - Nové přístupy k vakcíně navozující trvalou mateřskou imunitní odpověď, která ochrání novorozence před infekcí streptokokem skupiny B, 2007-2010, koordinátor- MUDr.P.Křížová, odborní spolupracovníci- MUDr.J.Kozáková, RNDr.J.Motlová.
• Evropský projekt - Sekvenční charakterizace vybraných bakteriálních agens působících závažná onemocnění v ČR, 2009-2010, koordinátor- MUDr.P.Křížová, odborný spolupracovník- RNDr.J.Motlová za agens Streptococcus  pneumoniae, Streptococcus.agalactiae a Streptococcus.pyogenes.