V období od 2. 12. do 10. 12. 2021 má NRL k dispozici data ze 41 857 provedených testů diskriminační PCR ze 74 laboratoří. Na variantu delta včetně subvariant připadá dle diskriminační PCR přibližně 98 % pozitivních případů.

Za rok 2021 bylo k 10. 12. v ČR celogenomově sekvenováno 16 876 SARS-CoV-2 pozitivních vzorků. Celkem 673 sekvenací je s datem odběru vzorku mezi 10. listopadem a 10. prosincem.

Podíl původní varianty delta v tomto období klesl pod 3 procenta (na 2,67 %) a převažují subvarianty delty - AY.43, AY.122, AY.4.

„Aktualizovaný přehled v rámci celé republiky o možných dalších záchytech varianty omikron na úrovni testů PCR, diskriminační PCR i celogenomové sekvenace, poskytuje Ministerstvo zdravotnictví ČR. Tato podezření i místa testování hlásí příslušné Krajské hygienické stanice k rukám hlavní hygieničky,“ vysvětluje ředitelka Státního zdravotního ústavu MUDr. Barbora Macková a doplňuje, že seznam sekvenujících laboratoří lze nalézt na webu MZ ČR. https://koronavirus.mzcr.cz/wp-content/uploads/2021/06/Sit-sekvenacnich-pracovist-08062021.pdf

Varianta omikron se přenáší pravděpodobně s vyšší účinností, ale klinická praxe dosud neposkytuje dostatečný přehled, aby bylo možné komentovat dopady na infikované. „Vzhledem k velkému počtu mutací a možnosti falešných negativit nelze v případě potvrzení či vyloučení podezření na omikron spoléhat pouze na výsledky diskriminačních PCR. Všechny suspektní případy mohou být vyloučeny pouze na základě celogenomové sekvenace,“ připomíná vedoucí Národní referenční laboratoře RNDr. Helena Jiřincová.

Podrobná zpráva NRL je přílohou této tiskové zprávy. 

 SARS CoV 2 podrobná zpráva 10. 12. 2021