Centra
Ředitel
Kancelář ředitele
Sekretariát
Podatelna
Pracoviště vzdělávání, výzkumu a zahraniční spolupráce
Krízové řízení
Středisko pro kvalitu a autorizaci (MUDr. Věra Chaloupková)
Oddělení biostatistiky (RNDr. Marek Malý, CSc.)
Středisko vědeckých informací (Mgr. Jana Veselá)
Odbor ICT
Útvar ředitele
Tiskový mluvčí
Sekretariát Národního antibiotického program
Expertní skupina pro zkoušení způsobilosti
Expertní pracovní skupina Národní imunizační komise MZČR
Právní odbor (Mgr. Tereza Pechanová)
Personální odbor (p. Hana Obdržálková)
Úsek náměstka pro ekonomickou a technickou činnost (ÚNETČ)
Sekretariát ÚNETČ
Ekonomický odbor
Firemní školka
Provozně technický odbor
Interní audit
Odborná centra
Centrum zdraví a životního prostředí (MUDr. Helena Kazmarová)
Sekretariát centra
Oddělení hygieny ovzduší (RNDr. Bohumil Kotlík)
Oddělení hygieny vody (MUDr. František Kožíšek)
Ústředí monitoringu a zdravotního stavu obyvatelstva (MUDr. Růžena Kubínová)
Oddělení hygieny odpadů (MUDr. Magdalena Zimová, CSc.)
Oddělení prvkové analýzy (Mgr. Kateřina Žádná)
Centrum zdraví, výživy a potravin (Prof. MVDr. Jiří Ruprich, CSc.)
Sekretariát
Oddělení analýzy bezpečnosti výživy a potravin (RNDr. Irena Řehůřková, Ph.D)
Oddělení hodnocení zdravotních rizik a aplikované výživy (Prof. MVDr. Jiří Ruprich, CSc.)
Centrum hygieny práce a pracovního lékařství (MUDr. V. Lipšová)
Sekretariát
Oddělení chemické bezpečnosti (Mgr. M. Weiszentein, Ph.D.)
Oddělení hygieny práce (MUDr. Michael Vít, Ph.D.)
Oddělení pracovního lékařství (MUDr. Vladimíra Lipšová)
Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovišti (RNDr. Jaroslav Mráz, CSc.)
Centrum podpory veřejného zdraví (MUDr. Marie Nejedlá)
Sekretariát
Národní manažer HIV/AIDS (MUDr. Anna Kubátová)
Oddělení podpory zdraví (MVDr. Anna Niklová)
Oddělení determinant zdraví (Mgr. Lenka Laiblová)
Oddělení well-beingu dětí a mladistvých (Mgr. Simona Bernardyová)
Centrum epidemiologie a mikrobiologie (MUDr. Jana Kozáková)
Oddělení epidemiologie infekčních nemocí (MUDr. Jan Kynčl, PhD.)
Oddělení bakteriálních vzdušných nákaz (MUDr. Jana Kozáková)
Oddělení bakteriální rezistence k antibiotikům a sbírka kultur (RNDr. Vladislav Jakubů, Ph.D.)
Oddělení respiračních, střevních a exantematických virových nákaz (MUDr. Radomíra Limberková)
Oddělení sexuálně přenosných nemocí (STI) (MUDr. Hana Zákoucká)
Oddělení zoonóz s přírodní ohniskovostí (RNDr. Petr Kodym, CSc.)
Oddělení dezinfekce, dezinsekce a deratizace (DDD) (Ing. Jan Urban, Ph.D.)
Oddělení pro přípravu půd a umývárny (Ing. Dagmar Štětinová)
Oddělení stafylokokových a alimentárních bakteriálních infekcí ()
Centrum toxikologie a zdravotní bezpečnosti (RNDr. Hana Bendová, Ph.D.)
Sekretariát
Oddělení pro chemickou bezpečnost výrobků (Ing. K.Vrbík)
Oddělení pro bezpečnost speciálních druhů potravin a mikrobiologii PBU (Ing. Daniela Winklerová)
Oddělení alternativních toxikologických metod (RNDr. Kristina Kejlová, Ph.D.)
Oddělení toxikogenomiky (Doc.RNDr. Pavel Souček, CSc.)
Oddělení biomedicíny (RNDr. Hana Bendová, Ph.D.)
Oddělení welfare pokusných zvířat